RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A MIP1P15801 1254 aa7.5□□□□□ -1.21
YHL009W-AYHL009W-A GLN1P32288 370 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
YHL009W-AYHL009W-A YPR204WQ08995 1032 aa7.48□□□□□ -1.21
YHL009W-AYHL009W-A ESS1P22696 170 aa7.47□□□□□ -1.21
YHL009W-AYHL009W-A ICP55P40051 511 aa7.47□□□□□ -1.21
YHL009W-AYHL009W-A ARG82P07250 355 aa7.45□□□□□ -1.22
YHL009W-AYHL009W-A VAC17P25591 423 aa7.45□□□□□ -1.22
YHL009W-AYHL009W-A LSC2P53312 427 aa7.44□□□□□ -1.22
YHL009W-AYHL009W-A YJU3P28321 313 aa7.43□□□□□ -1.22
YHL009W-AYHL009W-A UBP2Q01476 1272 aa7.43□□□□□ -1.22
YHL009W-AYHL009W-A PUS1Q12211 544 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YHL009W-AYHL009W-A LSB3P43603 459 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
YHL009W-AYHL009W-A YBL086CP38177 466 aa7.41□□□□□ -1.22
YHL009W-AYHL009W-A AAD14P42884 376 aa7.41□□□□□ -1.22
YHL009W-AYHL009W-A APP1P53933 587 aa7.41□□□□□ -1.22
YHL009W-AYHL009W-A ITT1Q04638 464 aa7.39□□□□□ -1.23
YHL009W-AYHL009W-A DPH6Q12429 685 aa7.39□□□□□ -1.23
YHL009W-AYHL009W-A DLD1P32891 587 aa7.38□□□□□ -1.23
YHL009W-AYHL009W-A YJR098CP47139 656 aa7.37□□□□□ -1.23
YHL009W-AYHL009W-A PHM7Q12252 991 aa7.37□□□□□ -1.23
YHL009W-AYHL009W-A TCB1Q12466 1186 aa7.37□□□□□ -1.23
YHL009W-AYHL009W-A GLC3P32775 704 aa7.36□□□□□ -1.23
YHL009W-AYHL009W-A RSC30P38781 883 aa7.36□□□□□ -1.23
YHL009W-AYHL009W-A EMW1P42842 904 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
YHL009W-AYHL009W-A YNR021WP53723 404 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
YHL009W-AYHL009W-A PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
YHL009W-AYHL009W-A ARG8P18544 423 aa7.34□□□□□ -1.23
YHL009W-AYHL009W-A ROG3P43602 733 aa7.33□□□□□ -1.24
YHL009W-AYHL009W-A OSH7P38755 437 aa7.32□□□□□ -1.24
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-MR1Q04215 440 aa7.32□□□□□ -1.24
YHL009W-AYHL009W-A CCP1P00431 361 aa7.31□□□□□ -1.24
YHL009W-AYHL009W-A KTR1P27810 393 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YHL009W-AYHL009W-A MKS1P34072 584 aa7.28□□□□□ -1.24
YHL009W-AYHL009W-A FIG4P42837 879 aa7.28□□□□□ -1.24
YHL009W-AYHL009W-A JJJ3P47138 172 aa7.28□□□□□ -1.24
YHL009W-AYHL009W-A LYS5P50113 272 aa7.28□□□□□ -1.24
YHL009W-AYHL009W-A NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data7.27□□□□□ -1.25not detected
YHL009W-AYHL009W-A DFG5Q05031 458 aa7.27□□□□□ -1.25
YHL009W-AYHL009W-A MDJ1P35191 511 aa7.26□□□□□ -1.25
YHL009W-AYHL009W-A CSN12P47130 423 aa7.26□□□□□ -1.25
YHL009W-AYHL009W-A BDS1Q08347 646 aa7.24□□□□□ -1.25
YHL009W-AYHL009W-A AIM7Q12156 149 aa7.22□□□□□ -1.25
YHL009W-AYHL009W-A TEC1P18412 486 aa7.2□□□□□ -1.26
YHL009W-AYHL009W-A RAD59Q12223 238 aa7.2□□□□□ -1.26
YHL009W-AYHL009W-A FBP26P32604 452 aa7.19□□□□□ -1.26
YHL009W-AYHL009W-A CCT8P47079 568 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
YHL009W-AYHL009W-A NSG2P53898 299 aa7.19□□□□□ -1.26
YHL009W-AYHL009W-A YFL066CP43538 392 aa7.17□□□□□ -1.26
YHL009W-AYHL009W-A STE6P12866 1290 aa7.16□□□□□ -1.26
YHL009W-AYHL009W-A NAM8Q00539 523 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
YHL009W-AYHL009W-A CDC19P00549 500 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
YHL009W-AYHL009W-A YPR084WQ06821 456 aa7.14□□□□□ -1.27
YHL009W-AYHL009W-A GUT2P32191 649 aa7.12□□□□□ -1.27
YHL009W-AYHL009W-A AI1P03875 834 aa7.11□□□□□ -1.27
YHL009W-AYHL009W-A VTC4P47075 721 aa7.11□□□□□ -1.27
YHL009W-AYHL009W-A ISU1Q03020 165 aa7.11□□□□□ -1.27
YHL009W-AYHL009W-A ATG20Q07528 640 aa7.11□□□□□ -1.27
YHL009W-AYHL009W-A THI72Q08579 599 aa7.1□□□□□ -1.27
YHL009W-AYHL009W-A CUZ1P53899 274 aa7.09□□□□□ -1.27
YHL009W-AYHL009W-A MAK16P10962 306 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
YHL009W-AYHL009W-A DAL1P32375 460 aa7.08□□□□□ -1.28
YHL009W-AYHL009W-A DLD3P39976 496 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
YHL009W-AYHL009W-A RPP2BP02400 110 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YHL009W-AYHL009W-A SSA2P10592 639 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YHL009W-AYHL009W-A CEM1P39525 442 aa7.06□□□□□ -1.28
YHL009W-AYHL009W-A STE20Q03497 939 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YHL009W-AYHL009W-A YPR053CQ6Q5F3 151 aa7.05□□□□□ -1.28
YHL009W-AYHL009W-A NAF1P53919 492 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YHL009W-AYHL009W-A FRA1Q07825 749 aa7.03□□□□□ -1.28
YHL009W-AYHL009W-A SKN7P38889 622 aa7□□□□□ -1.29
YHL009W-AYHL009W-A YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YHL009W-AYHL009W-A UBP15P50101 1230 aa6.99□□□□□ -1.29
YHL009W-AYHL009W-A DAT1P13483 248 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
YHL009W-AYHL009W-A DIT1P21623 536 aa6.98□□□□□ -1.29
YHL009W-AYHL009W-A WTM2Q12206 467 aa6.98□□□□□ -1.29
YHL009W-AYHL009W-A KIN1P13185 1064 aa6.97□□□□□ -1.29
YHL009W-AYHL009W-A MSN5P52918 1224 aa6.97□□□□□ -1.29
YHL009W-AYHL009W-A KRE33P53914 1056 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
YHL009W-AYHL009W-A ADE12P80210 433 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
YHL009W-AYHL009W-A SBP1P10080 294 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A SSN3P39073 555 aa6.96□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A ISR1Q06098 443 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A SYT1Q06836 1226 aa6.96□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A EMP47P43555 445 aa6.95□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A SLA1P32790 1244 aa6.94□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A ISF1P32488 338 aa6.93□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A UTR2P32623 467 aa6.93□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A CSE4P36012 229 aa6.93□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A AHP1P38013 176 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A MRX12P47084 519 aa6.93□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A TDA6Q06466 467 aa6.93□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A SPT2P06843 333 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A TBS1P38114 1094 aa6.92□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-DR3Q12441 440 aa6.92□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A SBE2P42223 864 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A YDR461C-AQ2V2P7 80 aa6.91□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A UTP7P40055 554 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A ALA1P40825 983 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A YMR187CQ03236 431 aa6.9□□□□□ -1.3
YHL009W-AYHL009W-A GUA1P38625 525 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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