RNA–Protein interactions for RNA: YGL163C

RAD54, Transcript of DNA-dependent ATPase that stimulates strand exchange, yeast

Gene RAD54, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD54	YGL163C	THI11	P47183	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	THI13	Q07748	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TSC11	P40061	1430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	MRM1	P25270	412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	SEC8	P32855	1065 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	ERP5	P38819	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	VAC8	P39968	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	YGL081W	P53156	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	PSH1	Q12161	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	STH1	P32597	1359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	GRX4	P32642	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	RTG3	P38165	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	RTT106	P40161	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	ENT2	Q05785	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	COG4	Q06096	861 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	MGE1	P38523	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	YHL050C	P38721	697 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	YHR219W	P38900	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	DNM1	P54861	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	MET5	P47169	1442 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	BLI1	P35727	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	NKP1	Q12493	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	DPB3	P27344	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	TGL4	P36165	910 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	IOC3	P43596	787 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	NSE3	Q05541	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	VTH1	P40438	1549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	VTH2	P40890	1549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	SEC6	P32844	805 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	NUP159	P40477	1460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	KAR5	Q04746	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
RAD54	YGL163C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	RPN12	P32496	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	CSE4	P36012	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	PPX1	P38698	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	MNN1	P39106	762 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	ALD3	P54114	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	ERP4	Q12450	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	NHA1	Q99271	985 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	MAD1	P40957	749 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	HO	P09932	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
RAD54	YGL163C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	YJL049W	P47048	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	MEH1	Q02205	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	STB3	Q12427	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	MYO4	P32492	1471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	MET1	P36150	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	RPN4	Q03465	531 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	MIF2	P35201	549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	HOS4	P40480	1083 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	YJR142W	P47173	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	WHI5	Q12416	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
RAD54	YGL163C	FUI1	P38196	639 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	YEN1	P40028	759 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	ECM23	Q02710	187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	OPI1	P21957	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	TEA1	P47988	759 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	TFC8	Q12308	588 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAD54	YGL163C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RAD54	YGL163C	UBP12	P39538	1254 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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