RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535353.3

CSAG2-201, Transcript of CSAG family member 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CSAG2, Length 237 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2-201ENST00000535353 JCADQ9P266 1359 aa15.45■□□□□ 0.06
CSAG2-201ENST00000535353 PREX2Q70Z35 1606 aa15.44■□□□□ 0.06
CSAG2-201ENST00000535353 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CSAG2-201ENST00000535353 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.42■□□□□ 0.06
CSAG2-201ENST00000535353 UGGT1Q9NYU2 1555 aa15.42■□□□□ 0.06
CSAG2-201ENST00000535353 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.42■□□□□ 0.06
CSAG2-201ENST00000535353 RXRBP28702 533 aa15.42■□□□□ 0.06
CSAG2-201ENST00000535353 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.42■□□□□ 0.06
CSAG2-201ENST00000535353 TNRQ92752 1358 aa15.41■□□□□ 0.06
CSAG2-201ENST00000535353 FOXD1Q16676 465 aa15.41■□□□□ 0.06
CSAG2-201ENST00000535353 RGS12O14924 1447 aa15.41■□□□□ 0.06
CSAG2-201ENST00000535353 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CSAG2-201ENST00000535353 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.39■□□□□ 0.05
CSAG2-201ENST00000535353 SHPRHQ149N8 1683 aa15.38■□□□□ 0.05
CSAG2-201ENST00000535353 ATP7AQ04656 1500 aa15.38■□□□□ 0.05
CSAG2-201ENST00000535353 NLRP1Q9C000 1473 aa15.38■□□□□ 0.05
CSAG2-201ENST00000535353 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CSAG2-201ENST00000535353 PZPP20742 1482 aa15.36■□□□□ 0.05
CSAG2-201ENST00000535353 MAP3K1Q13233 1512 aa15.36■□□□□ 0.05
CSAG2-201ENST00000535353 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CSAG2-201ENST00000535353 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.35■□□□□ 0.05
CSAG2-201ENST00000535353 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.34■□□□□ 0.05
CSAG2-201ENST00000535353 A2MP01023 1474 aa15.34■□□□□ 0.05
CSAG2-201ENST00000535353 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
CSAG2-201ENST00000535353 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.32■□□□□ 0.04
CSAG2-201ENST00000535353 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
CSAG2-201ENST00000535353 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.3■□□□□ 0.04
CSAG2-201ENST00000535353 GGT6Q6P531 493 aa15.29■□□□□ 0.04
CSAG2-201ENST00000535353 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.29■□□□□ 0.04
CSAG2-201ENST00000535353 TIAM1Q13009 1591 aa15.28■□□□□ 0.04
CSAG2-201ENST00000535353 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.27■□□□□ 0.04
CSAG2-201ENST00000535353 TMEM94Q12767 1356 aa15.27■□□□□ 0.04
CSAG2-201ENST00000535353 EP400Q96L91 3159 aa15.27■□□□□ 0.04
CSAG2-201ENST00000535353 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
CSAG2-201ENST00000535353 CLIP1P30622 1438 aa15.26■□□□□ 0.03
CSAG2-201ENST00000535353 MIA2Q96PC5 1412 aa15.26■□□□□ 0.03
CSAG2-201ENST00000535353 NHSL1Q5SYE7 1610 aa15.26■□□□□ 0.03
CSAG2-201ENST00000535353 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CSAG2-201ENST00000535353 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CSAG2-201ENST00000535353 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CSAG2-201ENST00000535353 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CSAG2-201ENST00000535353 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
CSAG2-201ENST00000535353 UBR1Q8IWV7 1749 aa15.24■□□□□ 0.03
CSAG2-201ENST00000535353 NWD1Q149M9 1564 aa15.24■□□□□ 0.03
CSAG2-201ENST00000535353 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CSAG2-201ENST00000535353 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
CSAG2-201ENST00000535353 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.22■□□□□ 0.03
CSAG2-201ENST00000535353 DIP2AQ14689 1571 aa15.21■□□□□ 0.03
CSAG2-201ENST00000535353 AFF2P51816 1311 aa15.2■□□□□ 0.02
CSAG2-201ENST00000535353 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CSAG2-201ENST00000535353 ABCC3O15438 1527 aa15.2■□□□□ 0.02
CSAG2-201ENST00000535353 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CSAG2-201ENST00000535353 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CSAG2-201ENST00000535353 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CSAG2-201ENST00000535353 ARHGAP23Q9P227 1491 aa15.18■□□□□ 0.02
CSAG2-201ENST00000535353 SLIT1O75093 1534 aa15.17■□□□□ 0.02
CSAG2-201ENST00000535353 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CSAG2-201ENST00000535353 YY1P25490 414 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG2-201ENST00000535353 MSH6P52701 1360 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG2-201ENST00000535353 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CSAG2-201ENST00000535353 SLAIN2Q9P270 581 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG2-201ENST00000535353 NCOA2Q15596 1464 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG2-201ENST00000535353 CCDC125Q86Z20 511 aa15.13■□□□□ 0.01
CSAG2-201ENST00000535353 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CSAG2-201ENST00000535353 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG2-201ENST00000535353 NGLY1Q96IV0 654 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG2-201ENST00000535353 FMN1Q68DA7 1419 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG2-201ENST00000535353 LTKP29376 864 aa15.08■□□□□ 0
CSAG2-201ENST00000535353 ERVK-7P63135 1459 aa15.08■□□□□ 0
CSAG2-201ENST00000535353 BCL9LQ86UU0 1499 aa15.08■□□□□ 0
CSAG2-201ENST00000535353 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.08■□□□□ 0
CSAG2-201ENST00000535353 KCNA6P17658 529 aa15.07■□□□□ 0
CSAG2-201ENST00000535353 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CSAG2-201ENST00000535353 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.06■□□□□ 0
CSAG2-201ENST00000535353 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CSAG2-201ENST00000535353 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.05■□□□□ -0
CSAG2-201ENST00000535353 TET3O43151 1660 aa15.04■□□□□ -0
CSAG2-201ENST00000535353 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.04■□□□□ -0
CSAG2-201ENST00000535353 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
CSAG2-201ENST00000535353 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.04■□□□□ -0
CSAG2-201ENST00000535353 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.03■□□□□ -0
CSAG2-201ENST00000535353 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CSAG2-201ENST00000535353 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CSAG2-201ENST00000535353 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.02■□□□□ -0
CSAG2-201ENST00000535353 C8orf37Q96NL8 207 aa15.02■□□□□ -0
CSAG2-201ENST00000535353 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CSAG2-201ENST00000535353 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15□□□□□ -0.01
CSAG2-201ENST00000535353 SETD5Q9C0A6 1442 aa15□□□□□ -0.01
CSAG2-201ENST00000535353 HRCP23327 699 aa14.99□□□□□ -0.01
CSAG2-201ENST00000535353 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CSAG2-201ENST00000535353 KIF3BO15066 747 aa14.98□□□□□ -0.01
CSAG2-201ENST00000535353 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CSAG2-201ENST00000535353 UNC13BO14795 1591 aa14.98□□□□□ -0.01
CSAG2-201ENST00000535353 PIK3C2BO00750 1634 aa14.97□□□□□ -0.01
CSAG2-201ENST00000535353 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.97□□□□□ -0.01
CSAG2-201ENST00000535353 EID1Q9Y6B2 187 aa14.97□□□□□ -0.01
CSAG2-201ENST00000535353 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.95□□□□□ -0.02
CSAG2-201ENST00000535353 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.95□□□□□ -0.02
CSAG2-201ENST00000535353 ATRNO75882 1429 aa14.95□□□□□ -0.02
CSAG2-201ENST00000535353 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms