RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517728.1

IGHVII-44-2-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-44-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-44-2, Length 250 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.13□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MAP3K1Q13233 1512 aa8.13□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa8.12□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.12□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 AFAP1Q8N556 730 aa8.12□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.12□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.11□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 REREQ9P2R6 1566 aa8.11□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.11□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.11□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NCOA2Q15596 1464 aa8.11□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.11□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PTPRMP28827 1452 aa8.1□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.1□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.1□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MADDQ8WXG6 1647 aa8.09□□□□□ -1.11
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ABCA6Q8N139 1617 aa8.08□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 AGLP35573 1532 aa8.08□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MLECQ14165 292 aa8.07□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.07□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ATP7AQ04656 1500 aa8.07□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.06□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa8.06□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8.06□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MBD5Q9P267 1494 aa8.06□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.05□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MIA2Q96PC5 1412 aa8.05□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.05□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.05□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.04□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 A2MP01023 1474 aa8.04□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ARHGEF5Q12774 1597 aa8.04□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.03□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TSPY4P0CV99 314 aa8.03□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TSPY10P0CW01 314 aa8.03□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.02□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PLXNC1O60486 1568 aa8.02□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.02□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NUBP1P53384 320 aa8.01□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RASEFQ8IZ41 740 aa8□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM212AQ96EL1 285 aa8□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LMTK3Q96Q04 1460 aa8□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MROH2AA6NES4 1674 aa7.98□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.98□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FGD6Q6ZV73 1430 aa7.98□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.98□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NPATQ14207 1427 aa7.97□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.97□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.97□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PKD2Q13563 968 aa7.97□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GGT6Q6P531 493 aa7.97□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.97□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C3P01024 1663 aa7.96□□□□□ -1.13
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KIF3BO15066 747 aa7.96□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GSE1Q14687 1217 aa7.96□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZMYM3Q14202 1370 aa7.96□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.95□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DUOX2Q9NRD8 1548 aa7.95□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ABCC5O15440 1437 aa7.95□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DAPK1P53355 1430 aa7.95□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.94□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HSPA2P54652 639 aa7.93□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa7.93□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa7.93□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KIF15Q9NS87 1388 aa7.93□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ERBINQ96RT1 1412 aa7.93□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PTPRKQ15262 1439 aa7.92□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HAX1O00165 279 aa7.91□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PZPP20742 1482 aa7.91□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.9□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ADGRL2O95490 1459 aa7.9□□□□□ -1.14
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PYGBP11216 843 aa7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms