RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAP2K5Q13163 448 aa11.44□□□□□ -0.58
RNU6-334P-201ENST00000517072 ADAM33Q9BZ11 813 aa11.44□□□□□ -0.58
RNU6-334P-201ENST00000517072 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.44□□□□□ -0.58
RNU6-334P-201ENST00000517072 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
RNU6-334P-201ENST00000517072 AK7Q96M32 723 aa11.43□□□□□ -0.58
RNU6-334P-201ENST00000517072 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.43□□□□□ -0.58
RNU6-334P-201ENST00000517072 ST18O60284 1047 aa11.42□□□□□ -0.58
RNU6-334P-201ENST00000517072 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
RNU6-334P-201ENST00000517072 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
RNU6-334P-201ENST00000517072 PTPREP23469 700 aa11.39□□□□□ -0.59
RNU6-334P-201ENST00000517072 ERBB3P21860 1342 aa11.38□□□□□ -0.59
RNU6-334P-201ENST00000517072 IRF6O14896 467 aa11.38□□□□□ -0.59
RNU6-334P-201ENST00000517072 EMP3P54852 163 aa11.37□□□□□ -0.59
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCNH8Q96L42 1107 aa11.37□□□□□ -0.59
RNU6-334P-201ENST00000517072 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.36□□□□□ -0.59
RNU6-334P-201ENST00000517072 FECHP22830 423 aa11.35□□□□□ -0.59
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCDC102AQ96A19 550 aa11.35□□□□□ -0.59
RNU6-334P-201ENST00000517072 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRIM66O15016 1216 aa11.32□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRSS12P56730 875 aa11.32□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 MARVELD3Q96A59 401 aa11.32□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 PBX2P40425 430 aa11.31□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 PADI6Q6TGC4 694 aa11.31□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 TTC13Q8NBP0 860 aa11.31□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 COL9A1P20849 921 aa11.3□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 CDCA7LQ96GN5 454 aa11.3□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCNK17Q96T54 332 aa11.3□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 NEUROD2Q15784 382 aa11.29□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM205CA6NFA0 338 aa11.28□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARHGAP33O14559 1287 aa11.28□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 OATP04181 439 aa11.28□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 AMHR2Q16671 573 aa11.28□□□□□ -0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 PDE4DQ08499 809 aa11.27□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.27□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.25□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa11.24□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.24□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 PACS2Q86VP3 889 aa11.23□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.23□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 NBPF26B4DH59 902 aa11.22□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.22□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 TSKSQ9UJT2 592 aa11.22□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 PSEN2P49810 448 aa11.21□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.21□□□□□ -0.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 CLCN1P35523 988 aa11.19□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 POTEEQ6S8J3 1075 aa11.19□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.19□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.19□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.19□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM161AQ3B820 660 aa11.18□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 PROX2Q3B8N5 592 aa11.18□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.17□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.17□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.16□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 TATDN2Q93075 761 aa11.16□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 PHOX2BQ99453 314 aa11.16□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 EYA1Q99502 592 aa11.16□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.16□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.16□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 POTEB3A0JP26 581 aa11.15□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.15□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 POTEBQ6S5H4 581 aa11.15□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 PNMA3Q9UL41 463 aa11.15□□□□□ -0.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 TK2O00142 265 aa11.14□□□□□ -0.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.14□□□□□ -0.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 KIAA1468Q9P260 1216 aa11.14□□□□□ -0.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.13□□□□□ -0.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 DNAJB2P25686 324 aa11.12□□□□□ -0.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 RCCD1A6NED2 376 aa11.11□□□□□ -0.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.11□□□□□ -0.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 NBPF3Q9H094 633 aa11.11□□□□□ -0.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 C3orf80F5H4A9 247 aa11.09□□□□□ -0.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.08□□□□□ -0.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.08□□□□□ -0.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 SMAPO00193 183 aa11.07□□□□□ -0.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.06□□□□□ -0.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 SULF1Q8IWU6 871 aa11.06□□□□□ -0.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 NLRP7Q8WX94 980 aa11.06□□□□□ -0.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM117AQ9C073 453 aa11.05□□□□□ -0.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 MS4A1P11836 297 aa11.04□□□□□ -0.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms