RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RNU6-377P-201ENST00000515965 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-377P-201ENST00000515965 IRF6O14896 467 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 FECHP22830 423 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 CERKQ8TCT0 537 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 AK7Q96M32 723 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAP2K5Q13163 448 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 TTC13Q8NBP0 860 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM66O15016 1216 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 ERBB3P21860 1342 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 COL9A1P20849 921 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPREP23469 700 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRSS12P56730 875 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 MARVELD3Q96A59 401 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-377P-201ENST00000515965 POTEB3A0JP26 581 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 EMP3P54852 163 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 POTEBQ6S5H4 581 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC102AQ96A19 550 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM205CA6NFA0 338 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGAP33O14559 1287 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDE4DQ08499 809 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 AMHR2Q16671 573 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 PADI6Q6TGC4 694 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADGRG1Q9Y653 693 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 OATP04181 439 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 PBX2P40425 430 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNK17Q96T54 332 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZBED2Q9BTP6 218 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSKSQ9UJT2 592 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 PSEN2P49810 448 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 HS3ST6Q96QI5 342 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 PHOX2BQ99453 314 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 NEUROD2Q15784 382 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM161AQ3B820 660 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 EYA1Q99502 592 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMUB1Q9BVT8 246 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-377P-201ENST00000515965 C3orf80F5H4A9 247 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 PROX2Q3B8N5 592 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 DMRTA1Q5VZB9 504 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 PACS2Q86VP3 889 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNH8Q96L42 1107 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 AXIN2Q9Y2T1 843 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 TATDN2Q93075 761 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 PARP9Q8IXQ6 854 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 KDM4CQ9H3R0 1056 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIAA1468Q9P260 1216 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 RABGEF1Q9UJ41 708 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 TK2O00142 265 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLCN1P35523 988 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM132AQ24JP5 1023 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 NUDT18Q6ZVK8 323 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 RCCD1A6NED2 376 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 NBPF26B4DH59 902 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 PNMA3Q9UL41 463 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPCPD1Q9NPB8 672 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 NLRP7Q8WX94 980 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMAPO00193 183 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 HRO43593 1189 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAJB2P25686 324 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM117AQ9C073 453 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM134Q9H6X4 195 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLEKHG3A1L390 1219 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 MS4A1P11836 297 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADGRD1Q6QNK2 874 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 LAPTM4BQ86VI4 370 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL27Q8NEV9 243 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDRGK1Q96HY6 314 aa5.87□□□□□ -1.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms