RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GOLGA8CPA6NN73 597 aa12.74□□□□□ -0.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHF14O94880 888 aa12.73□□□□□ -0.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.72□□□□□ -0.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGS20O76081 388 aa12.71□□□□□ -0.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXW7Q969H0 707 aa12.7□□□□□ -0.38
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DPYSL4O14531 572 aa12.66□□□□□ -0.38
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BCAMP50895 628 aa12.66□□□□□ -0.38
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa12.66□□□□□ -0.38
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LAPTM4BQ86VI4 370 aa12.65□□□□□ -0.38
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA1468Q9P260 1216 aa12.65□□□□□ -0.38
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SOWAHBA6NEL2 793 aa12.64□□□□□ -0.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKK1Q8NFD2 765 aa12.64□□□□□ -0.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPAS1Q99814 870 aa12.62□□□□□ -0.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa12.58□□□□□ -0.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WBP1LQ9NX94 342 aa12.58□□□□□ -0.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDX12PQ92771 950 aa12.56□□□□□ -0.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDIA6Q15084 440 aa12.52□□□□□ -0.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSKSQ9UJT2 592 aa12.52□□□□□ -0.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NYAP1Q6ZVC0 841 aa12.51□□□□□ -0.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM198AQ9UFP1 575 aa12.47□□□□□ -0.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C3orf80F5H4A9 247 aa12.46□□□□□ -0.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NBR1Q14596 966 aa12.46□□□□□ -0.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.46□□□□□ -0.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HPS5Q9UPZ3 1129 aa12.45□□□□□ -0.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNC4Q03721 635 aa12.44□□□□□ -0.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRCH3Q96II8 777 aa12.43□□□□□ -0.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP3K7O43318 606 aa12.42□□□□□ -0.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CFAP44Q96MT7 982 aa12.41□□□□□ -0.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMAPO00193 183 aa12.39□□□□□ -0.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDCA7LQ96GN5 454 aa12.39□□□□□ -0.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PACS2Q86VP3 889 aa12.38□□□□□ -0.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRSS12P56730 875 aa12.37□□□□□ -0.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TJAP1Q5JTD0 557 aa12.37□□□□□ -0.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LCE2BO14633 110 aa12.35□□□□□ -0.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAMD7Q7Z3H4 446 aa12.35□□□□□ -0.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 E2F4Q16254 413 aa12.34□□□□□ -0.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDHR5Q9HBB8 845 aa12.34□□□□□ -0.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLCB2Q00722 1185 aa12.33□□□□□ -0.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OSBPP22059 807 aa12.32□□□□□ -0.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP4CP60510 307 aa12.31□□□□□ -0.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TATDN2Q93075 761 aa12.31□□□□□ -0.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRXCR2A6NFK2 248 aa12.3□□□□□ -0.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CERKQ8TCT0 537 aa12.29□□□□□ -0.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q6ZNB5 142 aa12.27□□□□□ -0.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTC13Q8NBP0 860 aa12.27□□□□□ -0.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTRQ99707 1265 aa12.27□□□□□ -0.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNMA3Q9UL41 463 aa12.27□□□□□ -0.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NBPF26B4DH59 902 aa12.24□□□□□ -0.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUDT18Q6ZVK8 323 aa12.24□□□□□ -0.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF516Q92618 1163 aa12.24□□□□□ -0.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.24□□□□□ -0.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 APLP1P51693 650 aa12.23□□□□□ -0.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL21Q9HBE4 155 aa12.22□□□□□ -0.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R18Q6NYC8 613 aa12.21□□□□□ -0.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRKD2Q9BZL6 878 aa12.19□□□□□ -0.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PADI6Q6TGC4 694 aa12.17□□□□□ -0.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NKX2-3Q8TAU0 364 aa12.17□□□□□ -0.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GFRA3O60609 400 aa12.16□□□□□ -0.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LAPTM4AQ15012 233 aa12.16□□□□□ -0.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR70Q9NW82 654 aa12.15□□□□□ -0.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EYA1Q99502 592 aa12.14□□□□□ -0.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 V9GY48 417 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAF7Q6Q0C0 670 aa12.12□□□□□ -0.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF40O75150 1001 aa12.11□□□□□ -0.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COPS2P61201 443 aa12.07□□□□□ -0.48
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLF2Q8IX21 1173 aa12.05□□□□□ -0.48
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZPR1O75312 459 aa12.02□□□□□ -0.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTGDRQ13258 359 aa12.01□□□□□ -0.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NECTIN2Q92692 538 aa12□□□□□ -0.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12□□□□□ -0.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM67Q6ZTA4 783 aa11.99□□□□□ -0.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.99□□□□□ -0.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms