RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.67□□□□□ -0.86
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RBM39-211ENST00000426951 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RBM39-211ENST00000426951 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.66□□□□□ -0.86
RBM39-211ENST00000426951 MAP3K7O43318 606 aa9.65□□□□□ -0.86
RBM39-211ENST00000426951 ZMYND10O75800 440 aa9.63□□□□□ -0.87
RBM39-211ENST00000426951 FBXW7Q969H0 707 aa9.63□□□□□ -0.87
RBM39-211ENST00000426951 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.63□□□□□ -0.87
RBM39-211ENST00000426951 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RBM39-211ENST00000426951 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RBM39-211ENST00000426951 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.62□□□□□ -0.87
RBM39-211ENST00000426951 GPR37O15354 613 aa9.61□□□□□ -0.87
RBM39-211ENST00000426951 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.6□□□□□ -0.87
RBM39-211ENST00000426951 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.6□□□□□ -0.87
RBM39-211ENST00000426951 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RBM39-211ENST00000426951 FCHSD2O94868 740 aa9.59□□□□□ -0.87
RBM39-211ENST00000426951 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.59□□□□□ -0.87
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RBM39-211ENST00000426951 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.59□□□□□ -0.87
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RBM39-211ENST00000426951 HIC1Q14526 733 aa9.56□□□□□ -0.88
RBM39-211ENST00000426951 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RBM39-211ENST00000426951 FECHP22830 423 aa9.55□□□□□ -0.88
RBM39-211ENST00000426951 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.54□□□□□ -0.88
RBM39-211ENST00000426951 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.54□□□□□ -0.88
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RBM39-211ENST00000426951 COL9A1P20849 921 aa9.5□□□□□ -0.89
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RBM39-211ENST00000426951 KCNK17Q96T54 332 aa9.5□□□□□ -0.89
RBM39-211ENST00000426951 MAP2K5Q13163 448 aa9.49□□□□□ -0.89
RBM39-211ENST00000426951 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RBM39-211ENST00000426951 IRF6O14896 467 aa9.48□□□□□ -0.89
RBM39-211ENST00000426951 PADI6Q6TGC4 694 aa9.48□□□□□ -0.89
RBM39-211ENST00000426951 AK7Q96M32 723 aa9.48□□□□□ -0.89
RBM39-211ENST00000426951 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.47□□□□□ -0.89
RBM39-211ENST00000426951 CCDC102AQ96A19 550 aa9.47□□□□□ -0.89
RBM39-211ENST00000426951 PSEN2P49810 448 aa9.46□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.46□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 KCNH8Q96L42 1107 aa9.46□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.46□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 PRSS12P56730 875 aa9.45□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 FAM161AQ3B820 660 aa9.45□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.45□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.45□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 TRIM66O15016 1216 aa9.44□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 ARHGAP33O14559 1287 aa9.43□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.43□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 PROX2Q3B8N5 592 aa9.42□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 TTC13Q8NBP0 860 aa9.42□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 TSKSQ9UJT2 592 aa9.42□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 NEUROD2Q15784 382 aa9.41□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.41□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.41□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.4□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.4□□□□□ -0.9
RBM39-211ENST00000426951 PBX2P40425 430 aa9.39□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 PDE4DQ08499 809 aa9.39□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.39□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.911e-13■□□□□ 8.6
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RBM39-211ENST00000426951 PHOX2BQ99453 314 aa9.37□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 C3orf80F5H4A9 247 aa9.36□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.36□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 PACS2Q86VP3 889 aa9.36□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 SMAPO00193 183 aa9.35□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.35□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 NLRP7Q8WX94 980 aa9.35□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 TATDN2Q93075 761 aa9.35□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.35□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 PNMA3Q9UL41 463 aa9.35□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 NBPF26B4DH59 902 aa9.34□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 AMHR2Q16671 573 aa9.34□□□□□ -0.91
RBM39-211ENST00000426951 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.33□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.32□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 EYA1Q99502 592 aa9.32□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.32□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.32□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.31□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 RCCD1A6NED2 376 aa9.3□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 CLCN1P35523 988 aa9.28□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.28□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.28□□□□□ -0.92
RBM39-211ENST00000426951 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RBM39-211ENST00000426951 TK2O00142 265 aa9.27□□□□□ -0.93
RBM39-211ENST00000426951 DNAJB2P25686 324 aa9.26□□□□□ -0.93
RBM39-211ENST00000426951 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.26□□□□□ -0.93
RBM39-211ENST00000426951 NBPF3Q9H094 633 aa9.26□□□□□ -0.93
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