RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411660.1

RPS3AP25-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP25, Length 793 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP25-201ENST00000411660 KCNH8Q96L42 1107 aa13.28□□□□□ -0.28
RPS3AP25-201ENST00000411660 ADGRD1Q6QNK2 874 aa13.27□□□□□ -0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.27□□□□□ -0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 HRO43593 1189 aa13.24□□□□□ -0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa13.24□□□□□ -0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 GRXCR2A6NFK2 248 aa13.23□□□□□ -0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 NBR1Q14596 966 aa13.23□□□□□ -0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.23□□□□□ -0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa13.23□□□□□ -0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa13.21□□□□□ -0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 COL9A1P20849 921 aa13.21□□□□□ -0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 OSBPP22059 807 aa13.21□□□□□ -0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.21□□□□□ -0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
RPS3AP25-201ENST00000411660 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
RPS3AP25-201ENST00000411660 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
RPS3AP25-201ENST00000411660 MAP3K7O43318 606 aa13.15□□□□□ -0.3
RPS3AP25-201ENST00000411660 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
RPS3AP25-201ENST00000411660 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
RPS3AP25-201ENST00000411660 SEMA3EO15041 775 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3AP25-201ENST00000411660 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS3AP25-201ENST00000411660 PROX2Q3B8N5 592 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3AP25-201ENST00000411660 RABGEF1Q9UJ41 708 aa13.09□□□□□ -0.31
RPS3AP25-201ENST00000411660 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RPS3AP25-201ENST00000411660 CERKQ8TCT0 537 aa13.07□□□□□ -0.32
RPS3AP25-201ENST00000411660 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa13.06□□□□□ -0.32
RPS3AP25-201ENST00000411660 STAC3Q96MF2 364 aa13.05□□□□□ -0.32
RPS3AP25-201ENST00000411660 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.05□□□□□ -0.32
RPS3AP25-201ENST00000411660 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RPS3AP25-201ENST00000411660 KIAA1468Q9P260 1216 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS3AP25-201ENST00000411660 NBPF3Q9H094 633 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS3AP25-201ENST00000411660 PRSS12P56730 875 aa13.02□□□□□ -0.33
RPS3AP25-201ENST00000411660 TSKSQ9UJT2 592 aa13.02□□□□□ -0.33
RPS3AP25-201ENST00000411660 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
RPS3AP25-201ENST00000411660 CDCA7LQ96GN5 454 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS3AP25-201ENST00000411660 FAM198AQ9UFP1 575 aa13□□□□□ -0.33
RPS3AP25-201ENST00000411660 LAPTM4BQ86VI4 370 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS3AP25-201ENST00000411660 TTC13Q8NBP0 860 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS3AP25-201ENST00000411660 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
RPS3AP25-201ENST00000411660 SMYD5Q6GMV2 418 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS3AP25-201ENST00000411660 PACS2Q86VP3 889 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS3AP25-201ENST00000411660 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
RPS3AP25-201ENST00000411660 PTGDRQ13258 359 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 GOLGA8CPA6NN73 597 aa12.93□□□□□ -0.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 C3orf80F5H4A9 247 aa12.92□□□□□ -0.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 HCSTQ9UBK5 93 aa12.92□□□□□ -0.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 NUTM2FA1L443 756 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 WNT2BQ93097 391 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 PADI6Q6TGC4 694 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 THSD4Q6ZMP0 1018 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 TATDN2Q93075 761 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS3AP25-201ENST00000411660 NBPF26B4DH59 902 aa12.86□□□□□ -0.35
RPS3AP25-201ENST00000411660 SMAPO00193 183 aa12.86□□□□□ -0.35
RPS3AP25-201ENST00000411660 FCHSD2O94868 740 aa12.86□□□□□ -0.35
RPS3AP25-201ENST00000411660 ANKK1Q8NFD2 765 aa12.86□□□□□ -0.35
RPS3AP25-201ENST00000411660 PNMA3Q9UL41 463 aa12.86□□□□□ -0.35
RPS3AP25-201ENST00000411660 SOWAHBA6NEL2 793 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3AP25-201ENST00000411660 NUDT18Q6ZVK8 323 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3AP25-201ENST00000411660 GPR37O15354 613 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3AP25-201ENST00000411660 PTPN5P54829 565 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3AP25-201ENST00000411660 EYA1Q99502 592 aa12.81□□□□□ -0.36
RPS3AP25-201ENST00000411660 BCAMP50895 628 aa12.8□□□□□ -0.36
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIC1Q14526 733 aa12.8□□□□□ -0.36
RPS3AP25-201ENST00000411660 ADGRG1Q9Y653 693 aa12.78□□□□□ -0.36
RPS3AP25-201ENST00000411660 LRCH3Q96II8 777 aa12.77□□□□□ -0.37
RPS3AP25-201ENST00000411660 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
RPS3AP25-201ENST00000411660 SAMD7Q7Z3H4 446 aa12.76□□□□□ -0.37
RPS3AP25-201ENST00000411660 GNPATO15228 680 aa12.75□□□□□ -0.37
RPS3AP25-201ENST00000411660 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
RPS3AP25-201ENST00000411660 FECHP22830 423 aa12.74□□□□□ -0.37
RPS3AP25-201ENST00000411660 GPIHBP1Q8IV16 184 aa12.74□□□□□ -0.37
RPS3AP25-201ENST00000411660 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.37
RPS3AP25-201ENST00000411660 FAM161AQ3B820 660 aa12.72□□□□□ -0.37
RPS3AP25-201ENST00000411660 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
RPS3AP25-201ENST00000411660 WBP1LQ9NX94 342 aa12.72□□□□□ -0.37
RPS3AP25-201ENST00000411660 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
RPS3AP25-201ENST00000411660 HPS5Q9UPZ3 1129 aa12.71□□□□□ -0.37
RPS3AP25-201ENST00000411660 SLC24A1O60721 1099 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS3AP25-201ENST00000411660 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
RPS3AP25-201ENST00000411660 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
RPS3AP25-201ENST00000411660 NYAP1Q6ZVC0 841 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS3AP25-201ENST00000411660 OATP04181 439 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS3AP25-201ENST00000411660 PXYLP1Q8TE99 480 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS3AP25-201ENST00000411660 DNAJB2P25686 324 aa12.67□□□□□ -0.38
RPS3AP25-201ENST00000411660 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa12.67□□□□□ -0.38
RPS3AP25-201ENST00000411660 RCCD1A6NED2 376 aa12.66□□□□□ -0.38
RPS3AP25-201ENST00000411660 PPP4CP60510 307 aa12.66□□□□□ -0.38
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMEM134Q9H6X4 195 aa12.65□□□□□ -0.38
RPS3AP25-201ENST00000411660 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RPS3AP25-201ENST00000411660 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RPS3AP25-201ENST00000411660 LMOD2Q6P5Q4 547 aa12.63□□□□□ -0.39
RPS3AP25-201ENST00000411660 SLF2Q8IX21 1173 aa12.62□□□□□ -0.39
RPS3AP25-201ENST00000411660 IFFO2Q5TF58 517 aa12.61□□□□□ -0.39
RPS3AP25-201ENST00000411660 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms