RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
USP25-204ENST00000400183 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.07■■□□□ 1.28
USP25-204ENST00000400183 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
USP25-204ENST00000400183 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.06■■□□□ 1.28
USP25-204ENST00000400183 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
USP25-204ENST00000400183 KIF15Q9NS87 1388 aa23.05■■□□□ 1.28
USP25-204ENST00000400183 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.05■■□□□ 1.28
USP25-204ENST00000400183 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.05■■□□□ 1.28
USP25-204ENST00000400183 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
USP25-204ENST00000400183 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.04■■□□□ 1.28
USP25-204ENST00000400183 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
USP25-204ENST00000400183 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
USP25-204ENST00000400183 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
USP25-204ENST00000400183 ST18O60284 1047 aa23.01■■□□□ 1.27
USP25-204ENST00000400183 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23■■□□□ 1.27
USP25-204ENST00000400183 KIF3AQ9Y496 699 aa23■■□□□ 1.27
USP25-204ENST00000400183 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.99■■□□□ 1.27
USP25-204ENST00000400183 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
USP25-204ENST00000400183 JPH4Q96JJ6 628 aa22.98■■□□□ 1.27
USP25-204ENST00000400183 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.98■■□□□ 1.27
USP25-204ENST00000400183 KIF16BQ96L93 1317 aa22.97■■□□□ 1.27
USP25-204ENST00000400183 NUTM2FA1L443 756 aa22.97■■□□□ 1.27
USP25-204ENST00000400183 PANK3Q9H999 370 aa22.97■■□□□ 1.27
USP25-204ENST00000400183 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
USP25-204ENST00000400183 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
USP25-204ENST00000400183 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.95■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 TOMM22Q9NS69 142 aa22.95■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.94■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 UACAQ9BZF9 1416 aa22.94■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 PHF14O94880 888 aa22.93■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 G3V3G9 751 aa22.93■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.93■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.92■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 ARID3AQ99856 593 aa22.91■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 COG3Q96JB2 828 aa22.91■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 E9PSI1 815 aa22.9■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.89■■□□□ 1.26
USP25-204ENST00000400183 EVC2Q86UK5 1308 aa22.89■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 USP35Q9P2H5 1018 aa22.88■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.87■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.87■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.87■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.86■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.86■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.85■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 RILPL2Q969X0 211 aa22.85■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 FAM161AQ3B820 660 aa22.85■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.84■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 TEFQ10587 303 aa22.84■■□□□ 1.25
USP25-204ENST00000400183 MARCH6O60337 910 aa22.83■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.83■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 H3BQV1 296 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 TPM3P06753 285 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 IFFO2Q5TF58 517 aa22.82■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 USP47Q96K76 1375 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 PDE4AP27815 886 aa22.8■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.8■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.8■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.8■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 PLIN1O60240 522 aa22.79■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.79■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 COG6Q9Y2V7 657 aa22.78■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 GSE1Q14687 1217 aa22.78■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 NGEFQ8N5V2 710 aa22.78■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.77■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 APAF1O14727 1248 aa22.77■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 CEP89Q96ST8 783 aa22.77■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.77■■□□□ 1.24
USP25-204ENST00000400183 PTPRGP23470 1445 aa22.76■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 CRBNQ96SW2 442 aa22.76■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 VPS53Q5VIR6 699 aa22.75■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.75■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.75■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.75■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 REC8O95072 547 aa22.73■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.7 ms