RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 IGSF3O75054 1194 aa12.14□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 TBC1D2Q9BYX2 928 aa12.14□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 ANTXR1Q9H6X2 564 aa12.14□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa12.14□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 CHIC2Q9UKJ5 165 aa12.14□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.14□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 GAS2L3Q86XJ1 694 aa12.14□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 KLHL34Q8N239 644 aa12.14□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 KDM2BQ8NHM5 1336 aa12.13□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 E9PSI1 815 aa12.13□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.13□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM51Q9NW97 253 aa12.13□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 SYNJ1O43426 1573 aa12.12□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 NBPF8Q3BBV2 869 aa12.12□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 USP19O94966 1318 aa12.12□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 NASPP49321 788 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 CHMP5Q9NZZ3 219 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 UACAQ9BZF9 1416 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 PDE3BQ13370 1112 aa12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC173Q0VFZ6 552 aa12.08□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.47
TMOD1-203ENST00000395211 DDX11L8A8MPP1 907 aa12.08□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 TSC1Q92574 1164 aa12.08□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.07□□□□□ -0.487e-8■■■■□ 20.3
TMOD1-203ENST00000395211 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.06□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.06□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.06□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 SPDYE4A6NLX3 237 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 DYNC1I1O14576 645 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 TOPBP1Q92547 1522 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 FAM177BA6PVY3 158 aa12.05□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 CERS3Q8IU89 383 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 KDM5BQ9UGL1 1544 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 KIF20AO95235 890 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 TERF1P54274 439 aa12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 IGHDP01880 384 aa12.02□□□□□ -0.48
TMOD1-203ENST00000395211 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 PANK3Q9H999 370 aa12.01□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 TIAM1Q13009 1591 aa12.01□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 HSCBQ8IWL3 235 aa12.01□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 RSPH4AQ5TD94 716 aa12□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 SASS6Q6UVJ0 657 aa12□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 MPNDQ8N594 471 aa11.99□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 TBC1D32Q96NH3 1257 aa11.99□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 CUX1P39880 1505 aa11.99□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 GBP4Q96PP9 640 aa11.99□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.99□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 FMN1Q68DA7 1419 aa11.99□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 TOP2BQ02880 1626 aa11.99□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 PTMAP06454 111 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 IFT140Q96RY7 1462 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 KCNJ4P48050 445 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 ATP2B3Q16720 1220 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 NLRP13Q86W25 1043 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 KIF15Q9NS87 1388 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 PRXQ9BXM0 1461 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 RALBP1Q15311 655 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 PTPRKQ15262 1439 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-203ENST00000395211 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.96□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 ZBTB9Q96C00 473 aa11.95□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 C22orf23Q9BZE7 217 aa11.95□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 USP47Q96K76 1375 aa11.95□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.94□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 BCAR3O75815 825 aa11.94□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 HFM1A2PYH4 1435 aa11.94□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 COG6Q9Y2V7 657 aa11.94□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 NAIPQ13075 1403 aa11.94□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 GOLGA6L22H0YM25 854 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms