RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379565.7

RPS6KA3-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KA3, Length 7,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3-201ENST00000379565 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.083e-7■■■■■ 27.8
RPS6KA3-201ENST00000379565 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.83■■□□□ 1.08
RPS6KA3-201ENST00000379565 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.83■■□□□ 1.08
RPS6KA3-201ENST00000379565 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.82■■□□□ 1.08
RPS6KA3-201ENST00000379565 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RPS6KA3-201ENST00000379565 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3-201ENST00000379565 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3-201ENST00000379565 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KA3-201ENST00000379565 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RPS6KA3-201ENST00000379565 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RPS6KA3-201ENST00000379565 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
RPS6KA3-201ENST00000379565 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
RPS6KA3-201ENST00000379565 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 KIF16BQ96L93 1317 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 RILPL2Q969X0 211 aa21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 TPM3P06753 285 aa21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 VPS37DQ86XT2 251 aa21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.71■■□□□ 1.07
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RPS6KA3-201ENST00000379565 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA3-201ENST00000379565 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
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RPS6KA3-201ENST00000379565 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 H3BQV1 296 aa21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 IFFO2Q5TF58 517 aa21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 PTMSP20962 102 aa21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 TEFQ10587 303 aa21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.68■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 COG3Q96JB2 828 aa21.67■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 KIF3AQ9Y496 699 aa21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 NECTIN2Q92692 538 aa21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.65■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 APPP05067 770 aa21.65■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 PSME1Q06323 249 aa21.64■■□□□ 1.06
RPS6KA3-201ENST00000379565 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.63■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 NACADO15069 1562 aa21.63■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.62■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 SOGA1O94964 1423 aa21.61■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 MCTP1Q6DN14 999 aa21.61■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.61■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 ST18O60284 1047 aa21.6■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 TPM2P07951 284 aa21.59■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.58■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.58■■□□□ 1.05
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCER2I3L3R5 266 aa21.58■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.55■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.54■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.54■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRIM29Q14134 588 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 FYB1O15117 783 aa21.52■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 ATF3P18847 181 aa21.52■■□□□ 1.04
RPS6KA3-201ENST00000379565 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 PHF14O94880 888 aa21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 TPM1P09493 284 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.48■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 EVC2Q86UK5 1308 aa21.48■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 FMN1Q68DA7 1419 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 CPLX1O14810 134 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 MTMR7Q9Y216 660 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 BECN2A8MW95 431 aa21.46■■□□□ 1.03
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