RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 PLCH2O75038 1416 aa7.89□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 AFAP1Q8N556 730 aa7.89□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 MAGI2Q86UL8 1455 aa7.88□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.88□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.88□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.88□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 EEA1Q15075 1411 aa7.87□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 POTEHQ6S545 545 aa7.87□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.87□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 STRCQ7RTU9 1775 aa7.87□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 ABCA6Q8N139 1617 aa7.86□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa7.86□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa7.86□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 KLHL34Q8N239 644 aa7.85□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 CFAP44Q96MT7 982 aa7.85□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 CLIP1P30622 1438 aa7.85□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa7.84□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 C3P01024 1663 aa7.84□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.84□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 FMN1Q68DA7 1419 aa7.84□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa7.84□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 KDM5CP41229 1560 aa7.84□□□□□ -1.15
TMLHE-202ENST00000369439 SPOCK2Q92563 424 aa7.83□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 SOCS7O14512 581 aa7.82□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.82□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.82□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 ABCC1P33527 1531 aa7.82□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.81□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 PREX2Q70Z35 1606 aa7.81□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.8□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 NUBP1P53384 320 aa7.8□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa7.8□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.8□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 NCOA1Q15788 1441 aa7.79□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 SYCP2Q9BX26 1530 aa7.79□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.79□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 NBR1Q14596 966 aa7.79□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa7.79□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 PTPRTO14522 1441 aa7.78□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 MLH3Q9UHC1 1453 aa7.78□□□□□ -1.16
TMLHE-202ENST00000369439 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa7.77□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 REREQ9P2R6 1566 aa7.77□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.77□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP7.77□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 28.1
TMLHE-202ENST00000369439 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7.77□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 AGLP35573 1532 aa7.77□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 PIP4K2BP78356 416 aa7.76□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 GGT6Q6P531 493 aa7.76□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 FAM212AQ96EL1 285 aa7.76□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 ARXQ96QS3 562 aa7.76□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.76□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 ZMYM3Q14202 1370 aa7.75□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 RASEFQ8IZ41 740 aa7.75□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 CNTLNQ9NXG0 1405 aa7.75□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC18Q5T9S5 1454 aa7.75□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 ATP7AQ04656 1500 aa7.74□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 GSE1Q14687 1217 aa7.74□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa7.74□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.73□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.73□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 MROH2AA6NES4 1674 aa7.73□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 A2MP01023 1474 aa7.72□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 FYCO1Q9BQS8 1478 aa7.72□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 CCNB3Q8WWL7 1395 aa7.71□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 NPATQ14207 1427 aa7.71□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 PTPRKQ15262 1439 aa7.71□□□□□ -1.17
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.71□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 HAX1O00165 279 aa7.71□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 HSPA1LP34931 641 aa7.71□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 RGL2O15211 777 aa7.7□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.7□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 PLXNC1O60486 1568 aa7.7□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 MTUS2Q5JR59 1369 aa7.7□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.69□□□□□ -1.18
TMLHE-202ENST00000369439 PLA2R1Q13018 1463 aa7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms