RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
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PTPRM-201ENST00000332175 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
PTPRM-201ENST00000332175 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.96■■■□□ 2.07
PTPRM-201ENST00000332175 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
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PTPRM-201ENST00000332175 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
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PTPRM-201ENST00000332175 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.93■■■□□ 2.06
PTPRM-201ENST00000332175 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.93■■■□□ 2.06
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PTPRM-201ENST00000332175 RILPL2Q969X0 211 aa27.82■■■□□ 2.04
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PTPRM-201ENST00000332175 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.78■■■□□ 2.04
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PTPRM-201ENST00000332175 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
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PTPRM-201ENST00000332175 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
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PTPRM-201ENST00000332175 E9PSI1 815 aa27.55■■■□□ 2
PTPRM-201ENST00000332175 PSME1Q06323 249 aa27.54■■■□□ 2
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM34Q9BYJ4 488 aa27.54■■■□□ 2
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PTPRM-201ENST00000332175 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa27.53■■■□□ 2
PTPRM-201ENST00000332175 APAF1O14727 1248 aa27.52■■■□□ 2
PTPRM-201ENST00000332175 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
PTPRM-201ENST00000332175 APPP05067 770 aa27.52■■■□□ 2
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