RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa19.6■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 MORC1Q86VD1 984 aa19.6■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.6■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.59■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 APAF1O14727 1248 aa19.58■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 BRPF3Q9ULD4 1205 aa19.58■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.57■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 APBB1O00213 710 aa19.57■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 COG6Q9Y2V7 657 aa19.57■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 KCNJ4P48050 445 aa19.57■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.56■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.56■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 FGD1P98174 961 aa19.56■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 FAM161AQ3B820 660 aa19.56■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 PTMSP20962 102 aa19.55■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 NFKBIBQ15653 356 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 FAM13BQ9NYF5 915 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 ADAMTS8Q9UP79 889 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 PKNOX2Q96KN3 472 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 PLEKHG5O94827 1062 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 JPH4Q96JJ6 628 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 NESP48681 1621 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.51■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 PTPRKQ15262 1439 aa19.51■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.5■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 BACH2Q9BYV9 841 aa19.49■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 STK26Q9P289 416 aa19.48■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.48■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 MCCP23508 829 aa19.47■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 ERCC6Q03468 1493 aa19.46■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 DDX11L8A8MPP1 907 aa19.45■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.45■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 GGT6Q6P531 493 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 PANK1Q8TE04 598 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 KIF3BO15066 747 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.41■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 POGKQ9P215 609 aa19.41■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 C14orf37Q86TY3 774 aa19.4■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.39■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 BCAR3O75815 825 aa19.39■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 SOX12O15370 315 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 CFAP44Q96MT7 982 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 NCOA1Q15788 1441 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 PRDM2Q13029 1718 aa19.35■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.33■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 TOPBP1Q92547 1522 aa19.33■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 E9PSI1 815 aa19.33■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.33■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.33■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa19.32■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 DAPK1P53355 1430 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 PPP2R1AP30153 589 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.3■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 MAP3K1Q13233 1512 aa19.3■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.3■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 CHMP5Q9NZZ3 219 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 KANK1Q14678 1352 aa19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms