RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.82■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 CDR1P51861 262 aa20.81■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.8■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 AK7Q96M32 723 aa20.8■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 STK31Q9BXU1 1019 aa20.8■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.79■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 BECN2A8MW95 431 aa20.78■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.78■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 MRE11P49959 708 aa20.77■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.77■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 CEP89Q96ST8 783 aa20.77■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 CLSTN1O94985 981 aa20.77■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 NUCB2P80303 420 aa20.76■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 WIZO95785 1651 aa20.76■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 CCP110O43303 1012 aa20.76■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.75■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 CUX2O14529 1486 aa20.75■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.75■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.74■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 E9PSI1 815 aa20.74■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.74■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.74■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 DCTN1Q14203 1278 aa20.74■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 NPHP1O15259 732 aa20.72■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 A0A0G2JS52 829 aa20.72■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 H3BQV1 296 aa20.71■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 IFFO2Q5TF58 517 aa20.71■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 PRDM2Q13029 1718 aa20.7■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.7■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.7■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.69■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 RUFY1Q96T51 708 aa20.69■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.68■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.68■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.67■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 KIF21BO75037 1637 aa20.67■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.66■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 SOGA1O94964 1423 aa20.66■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.65■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.65■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 MBD3O95983 291 aa20.64■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.63■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 MYO6Q9UM54 1294 aa20.63■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 NUP155O75694 1391 aa20.62■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 APPP05067 770 aa20.62■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.62■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.62■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 HOMER1Q86YM7 354 aa20.61■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.61■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.61■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.61■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 PKD2Q13563 968 aa20.61■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.61■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 USP47Q96K76 1375 aa20.6■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.6■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.59■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 MNS1Q8NEH6 495 aa20.59■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.59■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 USP8P40818 1118 aa20.58■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 GORABQ5T7V8 394 aa20.58■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.58■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 RNF20Q5VTR2 975 aa20.57■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 SMARCA4P51532 1647 aa20.57■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 APBB1O00213 710 aa20.57■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.57■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 IFT57Q9NWB7 429 aa20.56■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.55■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 KCNH8Q96L42 1107 aa20.55■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 ZNF592Q92610 1267 aa20.55■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.54■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 MCM2P49736 904 aa20.54■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 NFKBIBQ15653 356 aa20.53■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 ERCC6Q03468 1493 aa20.53■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 H0YHG0 523 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms