RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.82■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 CDR1P51861 262 aa20.81■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.8■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 AK7Q96M32 723 aa20.8■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 STK31Q9BXU1 1019 aa20.8■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.79■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 BECN2A8MW95 431 aa20.78■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.78■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 MRE11P49959 708 aa20.77■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.77■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 CEP89Q96ST8 783 aa20.77■□□□□ 0.92
HCN1-201ENST00000303230 CLSTN1O94985 981 aa20.77■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 NUCB2P80303 420 aa20.76■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 WIZO95785 1651 aa20.76■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 CCP110O43303 1012 aa20.76■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.75■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 CUX2O14529 1486 aa20.75■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.75■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.74■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 E9PSI1 815 aa20.74■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.74■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.74■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 DCTN1Q14203 1278 aa20.74■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 NPHP1O15259 732 aa20.72■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 A0A0G2JS52 829 aa20.72■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 H3BQV1 296 aa20.71■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 IFFO2Q5TF58 517 aa20.71■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 PRDM2Q13029 1718 aa20.7■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.91
HCN1-201ENST00000303230 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.7■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.7■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.69■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 RUFY1Q96T51 708 aa20.69■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.68■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.68■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.67■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 KIF21BO75037 1637 aa20.67■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.66■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 SOGA1O94964 1423 aa20.66■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.65■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.65■□□□□ 0.9
HCN1-201ENST00000303230 MBD3O95983 291 aa20.64■□□□□ 0.9
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HCN1-201ENST00000303230 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.63■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 MYO6Q9UM54 1294 aa20.63■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 NUP155O75694 1391 aa20.62■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 APPP05067 770 aa20.62■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.62■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.62■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 HOMER1Q86YM7 354 aa20.61■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.61■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.61■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.61■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 PKD2Q13563 968 aa20.61■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.61■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 USP47Q96K76 1375 aa20.6■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.6■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.59■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 MNS1Q8NEH6 495 aa20.59■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.59■□□□□ 0.89
HCN1-201ENST00000303230 USP8P40818 1118 aa20.58■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 GORABQ5T7V8 394 aa20.58■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.58■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 RNF20Q5VTR2 975 aa20.57■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 SMARCA4P51532 1647 aa20.57■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 APBB1O00213 710 aa20.57■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.57■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 IFT57Q9NWB7 429 aa20.56■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.55■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 KCNH8Q96L42 1107 aa20.55■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 ZNF592Q92610 1267 aa20.55■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.54■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 MCM2P49736 904 aa20.54■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 NFKBIBQ15653 356 aa20.53■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 ERCC6Q03468 1493 aa20.53■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 H0YHG0 523 aa20.53■□□□□ 0.88
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