RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.87■■■□□ 2.21
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UBE2Q1-201ENST00000292211 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.55■■■□□ 2.16
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UBE2Q1-201ENST00000292211 ATP10AO60312 1499 aa28.4■■■□□ 2.14
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UBE2Q1-201ENST00000292211 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
UBE2Q1-201ENST00000292211 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.18■■■□□ 2.1
UBE2Q1-201ENST00000292211 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
UBE2Q1-201ENST00000292211 STAC3Q96MF2 364 aa28.18■■■□□ 2.1
UBE2Q1-201ENST00000292211 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
UBE2Q1-201ENST00000292211 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
UBE2Q1-201ENST00000292211 IL27Q8NEV9 243 aa28.16■■■□□ 2.1
UBE2Q1-201ENST00000292211 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.14■■■□□ 2.1
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