RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 DCTN1Q14203 1278 aa11.39□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 HDAC5Q9UQL6 1122 aa11.39□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa11.39□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.39□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 HSP90B2PQ58FF3 399 aa11.39□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 SMC4Q9NTJ3 1288 aa11.38□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 H0YHG0 523 aa11.38□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 MCTP1Q6DN14 999 aa11.38□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 DCAF11Q8TEB1 546 aa11.37□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 TOMM22Q9NS69 142 aa11.37□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.37□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 CEP164Q9UPV0 1460 aa11.37□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.37□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 CHMP4CQ96CF2 233 aa11.37□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 RALBP1Q15311 655 aa11.36□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 FAM184AQ8NB25 1140 aa11.36□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 WWC1Q8IX03 1113 aa11.35□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 FAM43AQ8N2R8 423 aa11.34□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 CCDC66A2RUB6 948 aa11.34□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.34□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 PKNOX2Q96KN3 472 aa11.34□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.34□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 MNS1Q8NEH6 495 aa11.34□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 IFT57Q9NWB7 429 aa11.33□□□□□ -0.59
TNS1-201ENST00000171887 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 236
TNS1-201ENST00000171887 G3V3G9 751 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 CAGE1Q8TC20 777 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 MYO6Q9UM54 1294 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 FAM161AQ3B820 660 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 PLCD4Q9BRC7 762 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 KIF27Q86VH2 1401 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 TRIM29Q14134 588 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 ODF2Q5BJF6 829 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 RILPL2Q969X0 211 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 PODXL2Q9NZ53 605 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 CCDC173Q0VFZ6 552 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 CCDC39Q9UFE4 941 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 BICD2Q8TD16 824 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 REC8O95072 547 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 LEKR1Q6ZMV7 388 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 EPS15P42566 896 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 FBXW7Q969H0 707 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-201ENST00000171887 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 CLUAP1Q96AJ1 413 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 NASPP49321 788 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 SASS6Q6UVJ0 657 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 STK26Q9P289 416 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 STK11IPQ8N1F8 1099 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 CPLX1O14810 134 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 INCENPQ9NQS7 918 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 PDE3BQ13370 1112 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 RUFY2Q8WXA3 655 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 TRIM34Q9BYJ4 488 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TNS1-201ENST00000171887 ANO2Q9NQ90 1003 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms