RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 236
TNS1-201ENST00000171887 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 126.2
TNS1-201ENST00000171887 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.8□□□□□ -0.845e-10■■■■■ 124.2
TNS1-201ENST00000171887 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.861e-8■■■■■ 103.4
TNS1-201ENST00000171887 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP10.11□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 78.1
TNS1-201ENST00000171887 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 63
TNS1-201ENST00000171887 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.849e-7■■■■■ 59.8
TNS1-201ENST00000171887 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.837e-7■■■■■ 57.4
TNS1-201ENST00000171887 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.79□□□□□ -11e-8■■■■■ 55.1
TNS1-201ENST00000171887 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.511e-8■■■■■ 49.3
TNS1-201ENST00000171887 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.038e-9■■■■■ 48.8
TNS1-201ENST00000171887 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 45.5
TNS1-201ENST00000171887 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.997e-9■■■■■ 43.2
TNS1-201ENST00000171887 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 40.1
TNS1-201ENST00000171887 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.785e-6■■■■■ 39.1
TNS1-201ENST00000171887 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP10.86□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 38.5
TNS1-201ENST00000171887 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 36.1
TNS1-201ENST00000171887 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.014e-6■■■■■ 35.3
TNS1-201ENST00000171887 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.823e-7■■■■■ 34.8
TNS1-201ENST00000171887 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.97e-13■■■■■ 32.6
TNS1-201ENST00000171887 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 29.6
TNS1-201ENST00000171887 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 27.7
TNS1-201ENST00000171887 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 27.6
TNS1-201ENST00000171887 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP10.82□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 27.5
TNS1-201ENST00000171887 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.933e-7■■■■□ 26.7
TNS1-201ENST00000171887 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.962e-7■■■■□ 26.4
TNS1-201ENST00000171887 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.733e-6■■■■□ 25.7
TNS1-201ENST00000171887 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.987e-7■■■■□ 25.4
TNS1-201ENST00000171887 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP10.87□□□□□ -0.678e-6■■■■□ 25.1
TNS1-201ENST00000171887 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.83e-6■■■■□ 25.1
TNS1-201ENST00000171887 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.758e-6■■■■□ 25
TNS1-201ENST00000171887 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.918e-7■■■■□ 24.7
TNS1-201ENST00000171887 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 24
TNS1-201ENST00000171887 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP10.57□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 23.8
TNS1-201ENST00000171887 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.865e-7■■■■□ 23.6
TNS1-201ENST00000171887 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.951e-7■■■■□ 23.6
TNS1-201ENST00000171887 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.953e-7■■■■□ 23.3
TNS1-201ENST00000171887 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.36□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 22.7
TNS1-201ENST00000171887 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.041e-7■■■■□ 21.3
TNS1-201ENST00000171887 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.934e-7■■■■□ 20.8
TNS1-201ENST00000171887 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.992e-6■■■■□ 20.8
TNS1-201ENST00000171887 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10.88□□□□□ -0.673e-8■■■■□ 20.7
TNS1-201ENST00000171887 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 19.3
TNS1-201ENST00000171887 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.786e-9■■■□□ 18.9
TNS1-201ENST00000171887 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.859e-7■■■□□ 18.7
TNS1-201ENST00000171887 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.21e-6■■■□□ 18.2
TNS1-201ENST00000171887 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.833e-7■■■□□ 17.6
TNS1-201ENST00000171887 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.882e-6■■■□□ 17.2
TNS1-201ENST00000171887 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.922e-6■■■□□ 16.7
TNS1-201ENST00000171887 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.961e-6■■■□□ 16.6
TNS1-201ENST00000171887 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.952e-6■■■□□ 16.4
TNS1-201ENST00000171887 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.853e-7■■■□□ 16.4
TNS1-201ENST00000171887 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.946e-7■■■□□ 15.8
TNS1-201ENST00000171887 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.812e-6■■■□□ 15.5
TNS1-201ENST00000171887 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.929e-7■■■□□ 15.2
TNS1-201ENST00000171887 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.733e-7■■□□□ 14.3
TNS1-201ENST00000171887 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.726e-7■■□□□ 13.8
TNS1-201ENST00000171887 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.643e-8■■□□□ 11.5
TNS1-201ENST00000171887 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.721e-6■□□□□ 11
TNS1-201ENST00000171887 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP11.18□□□□□ -0.623e-6■□□□□ 10.7
TNS1-201ENST00000171887 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.52e-8■□□□□ 9.6
TNS1-201ENST00000171887 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.36□□□□□ -0.912e-15■□□□□ 9.5
TNS1-201ENST00000171887 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.81e-7■□□□□ 9
TNS1-201ENST00000171887 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.635e-17■□□□□ 9
Retrieved 64 of 64 RNA–protein pairs in 13.8 ms