RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040676.10

Ankrd54-201, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd54, Length 1,904 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Polr3aB2RXC6 1390 aa28.93■■■□□ 2.22
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Nos1Q9Z0J4 1429 aa28.88■■■□□ 2.21
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Washc2Q6PGL7 1334 aa28.87■■■□□ 2.21
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Adamts13Q769J6 1426 aa28.72■■■□□ 2.19
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kdm5cP41230 1554 aa28.72■■■□□ 2.19
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm156Q58A37 223 aa28.71■■■□□ 2.19
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 OvosQ3UU35 1456 aa28.71■■■□□ 2.19
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Fndc1E9Q043 1732 aa28.7■■■□□ 2.19
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kif3bQ61771 747 aa28.69■■■□□ 2.18
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ak9G3UYQ4 1894 aa28.69■■■□□ 2.18
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa28.66■■■□□ 2.18
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Plch2A2AP18 1501 aa28.66■■■□□ 2.18
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Atp10aO54827 1508 aa28.66■■■□□ 2.18
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa28.66■■■□□ 2.18
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 AnkarA2RT91 1465 aa28.64■■■□□ 2.18
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Znf710Q3U288 666 aa28.64■■■□□ 2.18
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Setd1aE9PYH6 1716 aa28.64■■■□□ 2.18
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 AglF8VPN4 1532 aa28.63■■■□□ 2.17
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tulp4Q9JIL5 1547 aa28.62■■■□□ 2.17
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Abca6Q8K441 1624 aa28.61■■■□□ 2.17
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tnnt3Q9QZ47 272 aa28.61■■■□□ 2.17
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Uggt2E9Q4X2 1504 aa28.6■■■□□ 2.17
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa28.59■■■□□ 2.17
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa28.59■■■□□ 2.17
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Csrnp3P59055 597 aa28.59■■■□□ 2.17
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Abcc6Q9R1S7 1498 aa28.57■■■□□ 2.16
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ttc21bQ0HA38 1315 aa28.57■■■□□ 2.16
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa28.55■■■□□ 2.16
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kiaa0556Q8C753 1610 aa28.54■■■□□ 2.16
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Adgrl3Q80TS3 1537 aa28.54■■■□□ 2.16
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Iqgap3F8VQ29 1632 aa28.54■■■□□ 2.16
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Prex1Q69ZK0 1650 aa28.53■■■□□ 2.16
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Depdc5P61460 1591 aa28.52■■■□□ 2.16
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Col17a1Q07563 1470 aa28.5■■■□□ 2.15
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ptch1Q61115 1434 aa28.5■■■□□ 2.15
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Abca8aQ8K442 1620 aa28.47■■■□□ 2.15
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 RereQ80TZ9 1558 aa28.46■■■□□ 2.15
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Dip2cE9PWR4 1557 aa28.46■■■□□ 2.15
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 ErbinQ80TH2 1402 aa28.45■■■□□ 2.15
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Sall3Q62255 1320 aa28.44■■■□□ 2.14
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 AdgbG3UZ78 1657 aa28.4■■■□□ 2.14
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Trpm1Q2TV84 1622 aa28.38■■■□□ 2.13
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Akap12Q9WTQ5 1684 aa28.38■■■□□ 2.13
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa28.38■■■□□ 2.13
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cul9Q80TT8 1865 aa28.37■■■□□ 2.13
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tecpr2Q3UH45 1423 aa28.36■■■□□ 2.13
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa28.36■■■□□ 2.13
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 NrdcQ8BHG1 1161 aa28.35■■■□□ 2.13
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slc24a1Q91WD8 1130 aa28.35■■■□□ 2.13
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Pola1P33609 1465 aa28.35■■■□□ 2.13
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rims1Q99NE5 1463 aa28.35■■■□□ 2.13
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Efcab6Q6P1E8 1516 aa28.34■■■□□ 2.13
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