RNA–Protein interactions for RNA: YMR139W

RIM11, Transcript of Protein kinase, yeast

Gene RIM11, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM11	YMR139W	EXO84	P38261	753 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	YHK8	P38776	514 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	VMA22	P38784	181 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	YHR177W	P38867	453 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	GGC1	P38988	300 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	PCL6	P40038	420 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	GET2	P40056	285 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	SYG1	P40528	902 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	AZF1	P41696	914 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	YGR201C	P42936	225 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	YFR020W	P43600	232 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	COS12	P53053	380 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	RTS3	P53289	263 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	TRM82	Q03774	444 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	GRX3	Q03835	250 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	YLR446W	Q06204	433 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	TEN1	Q07921	160 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	DIN7	Q12086	430 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	SIA1	Q12212	622 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	THI4	P32318	326 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	OAC1	P32332	324 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	SPT14	P32363	452 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	MKK1	P32490	508 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	NDC1	P32500	655 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	ZRT3	P34240	503 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	CLG1	P35190	452 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	SCO2	P38072	301 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	AXL2	P38928	823 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	RCY1	P39531	840 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	SER33	P40510	469 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	CAF16	P43569	289 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	HMS2	P47175	358 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	PAC10	P48363	199 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	SDT1	P53078	280 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	MRH4	P53166	561 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	YGR079W	P53249	370 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	RNH70	P53331	553 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	MKC7	P53379	596 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	ALG12	P53730	551 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	YMR087W	Q04299	284 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	DCI1	Q08558	271 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	HSP42	Q12329	375 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	SCM3	Q12334	223 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	HIP1	P06775	603 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	MET2	P08465	486 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	CAP2	P13517	287 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	STF2	P16965	84 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	DBF2	P22204	572 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	KKQ8	P36004	724 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	TUL1	P36096	758 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	MNN2	P38069	597 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	RRN10	P38204	145 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	TAE1	P38340	232 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	BIG1	P38813	335 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	SBE22	P38814	852 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	MDM31	P38880	579 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	NVJ1	P38881	321 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	AIM2	P39721	246 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	BUR6	P40096	142 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	FAU1	P40099	211 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	APQ12	P40532	138 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	SER2	P42941	309 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	PRM10	P42946	383 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	FET5	P43561	622 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	IRC7	P43623	340 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	DIE2	P50076	525 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	NBP35	P52920	328 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	SGF73	P53165	657 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	TGL2	P54857	326 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	YSA1	Q01976	231 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	MRPL13	Q02204	264 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	MSC1	Q03104	513 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	SNZ1	Q03148	297 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	ABZ2	Q03266	374 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	PFA5	Q03289	374 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM11	YMR139W	PLP1	Q04004	230 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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