RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W CIK1Q01649 594 aa8□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W RCE1Q03530 315 aa8□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W YAP6Q03935 383 aa8□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W MHF1Q3E835 90 aa8□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W MF(ALPHA)1P01149 165 aa7.99□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W RPS1BP23248 255 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data7.99□□□□□ -1.13not detected
YLR349WYLR349W MAE1P36013 669 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W CHK1P38147 527 aa7.99□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W RRP4P38792 359 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W YIR020CP40575 100 aa7.99□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W SLS1P42900 643 aa7.99□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W SIP18P50263 79 aa7.99□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W RSC9Q03124 581 aa7.99□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W SSY1Q03770 852 aa7.99□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W GFD2P25370 566 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W YKL107WP34251 309 aa7.98□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W YHL044WP38727 235 aa7.98□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W EGT2P42835 1041 aa7.98□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W NCA3P46955 337 aa7.98□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W YNL181WP53878 407 aa7.98□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W RTR2Q12378 196 aa7.98□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W RPB8P20436 146 aa7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W HSP30P25619 332 aa7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W PPG1P32838 368 aa7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W KRE29P40026 464 aa7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W TWF1P53250 332 aa7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W SCS7Q03529 384 aa7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W KRE28Q04431 385 aa7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W SFH1Q06168 426 aa7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W SRL2Q12020 392 aa7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W YDL176WQ12027 708 aa7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W RTC5Q12108 567 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W RLM1Q12224 676 aa7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W DFG16Q99234 619 aa7.97□□□□□ -1.13
YLR349WYLR349W MDL1P33310 695 aa7.96□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W ROT2P38138 954 aa7.96□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W MNN9P39107 395 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W ARC35P53731 342 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W LGE1Q02796 332 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W NIP7Q08962 181 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W YOR343CQ12484 108 aa7.96□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W YPR015CQ12531 247 aa7.96□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W ATP2P00830 511 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W SEC12P11655 471 aa7.95□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W NUP1P20676 1076 aa7.95□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W EXG1P23776 448 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W YER188WP40103 239 aa7.95□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W PIG2P40187 538 aa7.95□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W MET28P40573 187 aa7.95□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W SBH2P52871 88 aa7.95□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W MTM1P53320 366 aa7.95□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W REP1P03871 373 aa7.94□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W DBP3P20447 523 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W CLB2P24869 491 aa7.94□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W GIT1P25346 518 aa7.94□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W YER121WP40076 114 aa7.94□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W VHR1P40522 640 aa7.94□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W YDR102CQ03864 110 aa7.94□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W RTN2Q12443 393 aa7.94□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa7.94□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa7.93□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W PEP4P07267 405 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W YPK2P18961 677 aa7.93□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W MCM10P32354 571 aa7.93□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W SAC1P32368 623 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W SLC1P33333 303 aa7.93□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W RSM24Q03976 319 aa7.93□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W RAD33Q04231 177 aa7.93□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W NTG2Q08214 380 aa7.93□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W HMS1Q12398 434 aa7.93□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W TIM12P32830 109 aa7.92□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W HIS7P33734 552 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W MTW1P39731 289 aa7.92□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W RLP7P40693 322 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W BRR6P53062 197 aa7.92□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W PEF1P53238 335 aa7.92□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W GAT3Q07928 141 aa7.92□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W FIT3Q08907 204 aa7.92□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W YPL191CQ08930 360 aa7.92□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W SUI3P09064 285 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W SIP2P34164 415 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W MRPL16P38064 232 aa7.91□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W UBC13P52490 153 aa7.91□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W RBG2P53295 368 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W MMT1Q03218 510 aa7.91□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
YLR349WYLR349W SPO77Q06134 477 aa7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.5 ms