RNA–Protein interactions for RNA: YAL059W

ECM1, Transcript of Pre-ribosomal factor involved in 60S ribosomal protein subunit export, yeast

Gene ECM1, Length 639 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM1	YAL059W	YGR210C	P42942	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	IRC7	P43623	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	NAS6	P50086	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	MTQ1	P53944	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	MMT1	Q03218	510 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	THI3	Q07471	609 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	REX4	Q08237	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	CRC1	Q12289	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	ATG34	Q12292	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	SNF8	Q12483	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	PPZ1	P26570	692 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	DEP1	P31385	405 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	DTR1	P38125	572 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	RPC17	P47076	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	BUD32	P53323	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	SED5	Q01590	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	RPO26	P20435	155 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	RBK1	P25332	333 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	CTR86	P25355	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	COQ3	P27680	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	COX13	P32799	129 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	SPO23	P33757	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	ARP1	P38696	384 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	TRM5	P38793	499 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	YAL037W	P39728	267 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	RPH1	P39956	796 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	SHO1	P40073	367 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	AZR1	P50080	613 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	OKP1	P53298	406 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	RRN9	P53437	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	SEC10	Q06245	871 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	PER33	Q12144	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM1	YAL059W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	QCR7	P00128	127 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	TPK3	P05986	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	QCR2	P07257	368 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	RPB8	P20436	146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	CLB2	P24869	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	ACB1	P31787	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	NUP2	P32499	720 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	PDR3	P33200	976 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	TAF14	P35189	244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	FES1	P38260	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	COX15	P40086	486 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	SLM1	P40485	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YIL024C	P40543	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	HMS2	P47175	358 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	MKC7	P53379	596 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	MRS2	Q01926	470 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	HER2	Q03557	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	ARP10	Q04549	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	RGT2	Q12300	763 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	ICT1	Q12385	394 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	SET6	Q12529	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	HEM2	P05373	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YCR006C	P25350	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	VAM7	P32912	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YBR056W	P38081	501 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	AME1	P38313	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	SNM1	P40993	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	GAB1	P41733	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	IDP2	P41939	412 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	GAT1	P43574	510 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YJR154W	P47181	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	PHB2	P50085	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	GPI15	P53961	229 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	PEX12	Q04370	399 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	PFA4	Q12006	378 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	ATP6	P00854	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	BAR1	P12630	587 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	SNA3	P14359	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	SEN2	P16658	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	MRPL8	P22353	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	MEI4	P29467	408 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	NDC1	P32500	655 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YKL097C	P34245	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	FIG1	P38224	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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