RNA–Protein interactions for RNA: YOR179C

SYC1, Transcript of Subunit of the APT subcomplex of cleavage and polyadenylation factor, yeast

Gene SYC1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYC1	YOR179C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	MIG3	P39943	394 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	OXA1	P39952	402 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	RTT105	P40063	208 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	YJR030C	P47101	745 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	SHY1	P53266	389 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	NAT4	Q04751	285 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	FAR1	P21268	830 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	MXR2	P25566	168 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	SUR1	P33300	382 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	MRPS5	P33759	307 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	ATG7	P38862	630 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	OSW5	P40219	148 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	LST7	P53237	242 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	MGR3	Q04472	501 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	LIP2	Q06005	328 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	CIN8	P27895	1000 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	HXT1	P32465	570 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	RIB7	P33312	244 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	RBG1	P39729	369 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	GAB1	P41733	394 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	KEG1	P43614	200 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	CIN2	P46670	268 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	SDT1	P53078	280 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
SYC1	YOR179C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	HMS1	Q12398	434 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	RGS2	Q99188	309 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	GAL3	P13045	520 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	NUP2	P32499	720 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	PPQ1	P32945	549 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	YOX1	P34161	385 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
SYC1	YOR179C	ABZ2	Q03266	374 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	YET2	Q04210	160 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	YMR027W	Q04371	470 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	MDY2	Q12285	212 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	HEM4	P06174	275 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	REV1	P12689	985 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	UTR1	P21373	530 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	PCH2	P38126	564 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	IST2	P38250	946 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	PFS1	P38872	237 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	YER186C	P40101	306 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	YMR134W	P40207	237 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	UBA3	Q99344	299 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	VPS63	O13549	108 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	OM45	P16547	393 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	DAL80	P26343	269 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	MKK1	P32490	508 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	MYO3	P36006	1272 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	YKR015C	P36111	568 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	IML3	P38265	245 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	YDR089W	P38966	869 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	HEM14	P40012	539 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	DFG10	P40526	253 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	VPS20	Q04272	221 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	MSC3	Q05812	728 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	BUR2	Q05949	395 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	STE23	Q06010	1027 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	YDR262W	Q12331	272 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYC1	YOR179C	RAD1	P06777	1100 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYC1	YOR179C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SYC1	YOR179C	GIT1	P25346	518 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYC1	YOR179C	LDB16	P25587	256 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYC1	YOR179C	CDC50	P25656	391 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYC1	YOR179C	PEX32	P38292	413 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYC1	YOR179C	END3	P39013	349 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYC1	YOR179C	TIM17	P39515	158 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYC1	YOR179C	SSO2	P39926	295 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYC1	YOR179C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SYC1	YOR179C	AIM20	P40451	204 aa		3.15	□□□□□ -1.91

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