RNA–Protein interactions for RNA: YMR270C

RRN9, Transcript of Protein involved in promoting high level transcription of rDNA, yeast

Gene RRN9, Length 1,098 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN9	YMR270C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	CSN9	Q03981	162 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SWA2	Q06677	668 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	USV1	Q12132	391 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	TPK2	P06245	380 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SIR3	P06701	978 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SPT3	P06844	337 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RPO26	P20435	155 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	ADH7	P25377	361 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SIP1	P32578	815 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	ASK1	P35734	292 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SWH1	P35845	1188 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YBR062C	P38239	180 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RPS27B	P38711	82 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	PEP8	P40335	379 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	ICE2	P40499	491 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YIL001W	P40560	513 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	PAC11	P40960	533 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	GCD10	P41814	478 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	HXT14	P42833	540 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	STB2	P46679	850 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YJL163C	P46996	555 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YIP4	P53093	235 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SNF12	P53628	566 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	BUD17	P53727	317 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YNL140C	P53910	189 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	NUP53	Q03790	475 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RAD34	Q06665	692 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	REX4	Q08237	289 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MMT2	Q08970	484 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	GET4	Q12125	312 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RLM1	Q12224	676 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	TPO4	Q12256	659 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	TRM13	Q12383	476 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SKS1	Q12505	502 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	HFA1	P32874	2273 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	STE7	P06784	515 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	COR1	P07256	457 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	CNE1	P27825	502 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	NAM9	P27929	486 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MRE11	P32829	692 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MSY1	P48527	492 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YGR151C	P53287	111 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	BIO4	P53630	237 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SLM2	P53955	656 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MPS1	P54199	764 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RSM28	Q03430	361 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	BAG7	Q12128	409 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RKI1	Q12189	258 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RUP1	Q12242	671 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MRP13	P12686	339 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	CBS2	P14905	389 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	ERG4	P25340	473 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	TRX3	P25372	127 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	DOA1	P36037	715 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	THI2	P38141	450 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YEL020C	P39994	560 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	FMP52	P40008	231 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	ALG5	P40350	334 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	ATF1	P40353	525 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	COA1	P40452	197 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YIL152W	P40455	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	AZF1	P41696	914 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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