RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 HIP1RO75146 1068 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 AKAP3O75969 853 aa9□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 GRM1Q13255 1194 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 ODR4Q5SWX8 454 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 RRAGAQ7L523 313 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 STAM2O75886 525 aa8.99□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 CASP4P49662 377 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 ALCAMQ13740 583 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 TUBB2AQ13885 445 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 UGCGQ16739 394 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 MNS1Q8NEH6 495 aa8.99□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.99□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.99□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.99□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 ERO1BQ86YB8 467 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 CHST13Q8NET6 341 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.99□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
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PDE4D-208ENST00000502484 KSR1Q8IVT5 923 aa8.98□□□□□ -0.97
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