RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 RNF34Q969K3 372 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNS1-201ENST00000306117 FAM161BQ96MY7 647 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNS1-201ENST00000306117 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
KCNS1-201ENST00000306117 SNX12Q9UMY4 172 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNS1-201ENST00000306117 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
KCNS1-201ENST00000306117 ITSN1Q15811 1721 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNS1-201ENST00000306117 K7ENM7 598 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNS1-201ENST00000306117 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
KCNS1-201ENST00000306117 TDP2O95551 362 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNS1-201ENST00000306117 KLC1Q07866 573 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNS1-201ENST00000306117 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
KCNS1-201ENST00000306117 AMACRQ9UHK6 382 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNS1-201ENST00000306117 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
KCNS1-201ENST00000306117 PMS2P54278 862 aa16.71■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 ODR4Q5SWX8 454 aa16.71■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 C10orf76Q5T2E6 689 aa16.71■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM42Q8IWZ5 723 aa16.71■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 AK8Q96MA6 479 aa16.71■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 EHD4Q9H223 541 aa16.71■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa16.71■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 TECPR2O15040 1411 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 E9PMD0 336 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 GSTA1P08263 222 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 GSTA2P09210 222 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 DYNLT1P63172 113 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 CPXCR1Q8N123 301 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 KIF2BQ8N4N8 673 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 SUPT20HQ8NEM7 779 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 NSMCE1Q8WV22 266 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 SGSM3Q96HU1 749 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 EMILIN3Q9NT22 766 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 CFAP69A5D8W1 941 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 HAUS5O94927 633 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 BASP1P80723 227 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 MYL7Q01449 175 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM9Q9C026 710 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 MINPP1Q9UNW1 487 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 BCS1LQ9Y276 419 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 KRT81Q14533 505 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 BRIP1Q9BX63 1249 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 PLS3P13797 630 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 CARSP49589 748 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 PMS1P54277 932 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 GALNT17Q6IS24 598 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 SEC16BQ96JE7 1060 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 GINS2Q9Y248 185 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 DIP2AQ14689 1571 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 PODXLO00592 558 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 TTC4O95801 387 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 IL1RL1Q01638 556 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 CLEC10AQ8IUN9 316 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 USP17L5A8MUK1 530 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 MYL1P05976 194 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 PTK2Q05397 1052 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 USP40Q9NVE5 1235 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 STK24Q9Y6E0 443 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 STXBP3O00186 592 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 ATICP31939 592 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 SDCCAG3Q96C92 435 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 EFHD1Q9BUP0 239 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 PCP11498 1178 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 DNAAF5Q86Y56 855 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 DRC3Q9H069 523 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 TOM1O60784 492 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 TMPRSS15P98073 1019 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 MCUQ8NE86 351 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 CDKL2Q92772 493 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 ERVV-1B6SEH8 477 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 LAD1O00515 517 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 DOK7Q18PE1 504 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 MAP7D3Q8IWC1 876 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 PYROXD1Q8WU10 500 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 HDAC7Q8WUI4 952 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 SAYSD1Q9NPB0 183 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 GINM1Q9NU53 330 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 SLC8A3P57103 927 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 ZIM3Q96PE6 472 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms