RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	YLR283W	Q05867	314 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	BUR2	Q05949	395 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	COS7	Q07788	383 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MED1	Q12321	566 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	GPM3	Q12326	303 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SEY1	Q99287	776 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YPL229W	Q99395	206 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	REP2	P03872	296 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PDX1	P16451	410 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CKI1	P20485	582 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	DAL80	P26343	269 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ADE1	P27616	306 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ITR1	P30605	584 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ITR2	P30606	609 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	VMA11	P32842	164 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	DOA1	P36037	715 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	EHT1	P38295	451 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RPS27B	P38711	82 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MTC6	P38849	526 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YHR218W	P38899	603 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SAW1	P39735	261 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	AGE2	P40529	298 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.38	□□□□□ -2.35	not detected
AI1	Q0050	IDP2	P41939	412 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RPE1	P46969	238 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	EMC4	P53073	190 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PGA2	P53903	129 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	EFM6	P53970	246 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	AIM33	Q04516	312 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YLR287C	Q05881	355 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TPO3	Q06451	622 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ARR2	Q06597	130 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ATG23	Q06671	453 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	OPY2	Q06810	360 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YOR365C	Q08844	703 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YOR378W	Q08902	515 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	FRE3	Q08905	711 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PGC1	Q08959	321 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MHF1	Q3E835	90 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	COS2	P0CX12	379 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	COS3	P0CX13	379 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RPS23B	P0CX30	145 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CBS2	P14905	389 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ALG1	P16661	449 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	HNM1	P19807	563 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TYR1	P20049	452 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CNA1	P23287	553 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MGR1	P25573	417 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	STP22	P25604	385 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PPG1	P32838	368 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CLG1	P35190	452 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	HSL7	P38274	827 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	GGC1	P38988	300 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RBG1	P39729	369 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YIL092W	P40497	633 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	0.37	□□□□□ -2.35	not detected
AI1	Q0050	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	COS4	P43542	379 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RPA43	P46669	326 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PGU1	P47180	361 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MSY1	P48527	492 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PHB2	P50085	310 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RSM27	P53305	110 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	FRE4	P53746	719 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	IBD2	P53892	351 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CBK1	P53894	756 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	BOP3	P53958	396 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YPL077C	Q02831	240 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YMR279C	Q03263	540 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TDA1	Q03533	586 aa		0.37	□□□□□ -2.35

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