RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 Q9UFV3 132 aa5.11□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 SLC12A8A0AV02 714 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 KCNK3O14649 394 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 FOXP2O15409 715 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 CDC14BO60729 498 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 RASGRP1O95267 797 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 MMEP08473 750 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 MEOX1P50221 254 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 KCNQ1P51787 676 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 TRIM68Q6AZZ1 485 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 USP30Q70CQ3 517 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 Q8N1X5 172 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 SLC7A14Q8TBB6 771 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 ASB15Q8WXK1 588 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 FAM89AQ96GI7 184 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 GBP4Q96PP9 640 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 SORCS2Q96PQ0 1159 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 DNAJC7Q99615 494 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 AMNQ9BXJ7 453 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 UCKL1Q9NWZ5 548 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 COQ6Q9Y2Z9 468 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 ACVRL1P37023 503 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 ADCY8P40145 1251 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 MAP3K12Q12852 859 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 SEC23AQ15436 765 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 C2orf27AQ580R0 203 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 GRAMD4Q6IC98 578 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 OVCH1Q7RTY7 1134 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 BRAPQ7Z569 592 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 RTKN2Q8IZC4 609 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 HIPK4Q8NE63 616 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 DLG3Q92796 817 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 SCLYQ96I15 445 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 DPYSL5Q9BPU6 564 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 OR10A2Q9H208 303 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3-204ENST00000561685 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 PMS2P1A4D2B8 440 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 AMHP03971 560 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 CD83Q01151 205 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 DUSP8Q13202 625 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 MOGSQ13724 837 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 PCOLCEQ15113 449 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 ARHGAP44Q17R89 818 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 C2orf69Q8N8R5 385 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 OR14A2Q96R54 314 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 BOCQ9BWV1 1114 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 PLA2G12BQ9BX93 195 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 NELFAQ9H3P2 528 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 B4E1Z4 1266 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 GOLGA6L22H0YM25 854 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 MATN2O00339 956 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 PLD2O14939 933 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 FNTBP49356 437 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 MRE11P49959 708 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 IRF9Q00978 393 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 TBR1Q16650 682 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 TM4SF20Q53R12 229 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 TMEM177Q53S58 311 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 MIIPQ5JXC2 388 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 OTOP1Q7RTM1 612 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 CFHR4Q92496 578 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 LPPQ93052 612 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 E2F7Q96AV8 911 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 TRIM39Q9HCM9 518 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 VWA7Q9Y334 891 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa5.07□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 RASSF10A6NK89 507 aa5.06□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 HMGA2P52926 109 aa5.06□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 FOXE3Q13461 319 aa5.06□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 TMEM132BQ14DG7 1078 aa5.06□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 FSTL4Q6MZW2 842 aa5.06□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa5.06□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 IGSF22Q8N9C0 903 aa5.06□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 FOXB1Q99853 325 aa5.06□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 SLC26A4O43511 780 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 KCNA6P17658 529 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 HGFACQ04756 655 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 NFE2L2Q16236 605 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 NRN1LQ496H8 165 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms