RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 FBXO47Q5MNV8 452 aa34.52■■■■□ 3.12
INO80B-201ENST00000233331 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP34.52■■■■□ 3.12
INO80B-201ENST00000233331 TLL1O43897 1013 aa34.51■■■■□ 3.12
INO80B-201ENST00000233331 AMHP03971 560 aa34.51■■■■□ 3.12
INO80B-201ENST00000233331 CA3P07451 260 aa34.51■■■■□ 3.12
INO80B-201ENST00000233331 PPP2R5CQ13362 524 aa34.51■■■■□ 3.12
INO80B-201ENST00000233331 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.12
INO80B-201ENST00000233331 NME8Q8N427 588 aa34.51■■■■□ 3.12
INO80B-201ENST00000233331 ZBED2Q9BTP6 218 aa34.51■■■■□ 3.12
INO80B-201ENST00000233331 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa34.51■■■■□ 3.12
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INO80B-201ENST00000233331 SLFN12Q8IYM2 578 aa34.49■■■■□ 3.11
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INO80B-201ENST00000233331 GINS2Q9Y248 185 aa34.47■■■■□ 3.11
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INO80B-201ENST00000233331 XKR3Q5GH77 459 aa34.46■■■■□ 3.11
INO80B-201ENST00000233331 NCAPH2Q6IBW4 605 aa34.46■■■■□ 3.11
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INO80B-201ENST00000233331 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa34.46■■■■□ 3.11
INO80B-201ENST00000233331 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
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INO80B-201ENST00000233331 CLCN3P51790 818 aa34.45■■■■□ 3.11
INO80B-201ENST00000233331 USP38Q8NB14 1042 aa34.45■■■■□ 3.11
INO80B-201ENST00000233331 PPP1R16BQ96T49 567 aa34.45■■■■□ 3.11
INO80B-201ENST00000233331 SQORQ9Y6N5 450 aa34.45■■■■□ 3.11
INO80B-201ENST00000233331 CDH23Q9H251 3354 aa34.45■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 MTERF2Q49AM1 385 aa34.44■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 EFCAB12Q6NXP0 572 aa34.44■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 LRRC71Q8N4P6 559 aa34.44■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 RAD9AQ99638 391 aa34.44■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 KIF3AQ9Y496 699 aa34.44■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa34.43■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 LCHNA4D1U4 455 aa34.43■■■■□ 3.1
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INO80B-201ENST00000233331 DDX11L8A8MPP1 907 aa34.42■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 TMOD1P28289 359 aa34.42■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 MCM7P33993 719 aa34.42■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 SPIRE1Q08AE8 756 aa34.42■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 PAK2Q13177 524 aa34.42■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 EPHA7Q15375 998 aa34.42■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
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INO80B-201ENST00000233331 CHD9Q3L8U1 2897 aa34.42■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 MYO9BQ13459 2157 aa34.41■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.1
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INO80B-201ENST00000233331 LINC01465Q8N7H1 131 aa34.41■■■■□ 3.1
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INO80B-201ENST00000233331 CERS4Q9HA82 394 aa34.41■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 SUGCTQ9HAC7 445 aa34.41■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 CDHR5Q9HBB8 845 aa34.41■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 PADI3Q9ULW8 664 aa34.41■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 PCDHA12Q9UN75 941 aa34.41■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 UPP2O95045 317 aa34.4■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 TXKP42681 527 aa34.4■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 KIZQ2M2Z5 673 aa34.4■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 LXNQ9BS40 222 aa34.4■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 TMEM266Q2M3C6 531 aa34.39■■■■□ 3.1
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INO80B-201ENST00000233331 ANO5Q75V66 913 aa34.39■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 TOP1MTQ969P6 601 aa34.39■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 DYDC2Q96IM9 177 aa34.39■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 MTMR9Q96QG7 549 aa34.39■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 OSMRQ99650 979 aa34.39■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 TMEM60Q9H2L4 133 aa34.39■■■■□ 3.1
INO80B-201ENST00000233331 GJB2P29033 226 aa34.38■■■■□ 3.09
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