Protein–RNA interactions for Protein: Q15375

EPHA7, Ephrin type-A receptor 7, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA7Q15375 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
EPHA7Q15375 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
EPHA7Q15375 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
EPHA7Q15375 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
EPHA7Q15375 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
EPHA7Q15375 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
EPHA7Q15375 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EPHA7Q15375 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
EPHA7Q15375 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
EPHA7Q15375 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
EPHA7Q15375 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
EPHA7Q15375 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
EPHA7Q15375 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
EPHA7Q15375 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
EPHA7Q15375 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
EPHA7Q15375 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
EPHA7Q15375 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
EPHA7Q15375 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
EPHA7Q15375 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
EPHA7Q15375 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
EPHA7Q15375 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
EPHA7Q15375 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
EPHA7Q15375 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
EPHA7Q15375 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
EPHA7Q15375 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
EPHA7Q15375 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
EPHA7Q15375 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
EPHA7Q15375 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.14
EPHA7Q15375 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EPHA7Q15375 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EPHA7Q15375 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EPHA7Q15375 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
EPHA7Q15375 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
EPHA7Q15375 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EPHA7Q15375 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
EPHA7Q15375 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EPHA7Q15375 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
EPHA7Q15375 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EPHA7Q15375 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
EPHA7Q15375 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
EPHA7Q15375 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EPHA7Q15375 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
EPHA7Q15375 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
EPHA7Q15375 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
EPHA7Q15375 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
EPHA7Q15375 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
EPHA7Q15375 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
EPHA7Q15375 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
EPHA7Q15375 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
EPHA7Q15375 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EPHA7Q15375 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
EPHA7Q15375 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
EPHA7Q15375 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
EPHA7Q15375 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
EPHA7Q15375 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
EPHA7Q15375 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
EPHA7Q15375 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
EPHA7Q15375 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
EPHA7Q15375 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EPHA7Q15375 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
EPHA7Q15375 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EPHA7Q15375 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EPHA7Q15375 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EPHA7Q15375 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EPHA7Q15375 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
EPHA7Q15375 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
EPHA7Q15375 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EPHA7Q15375 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
EPHA7Q15375 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
EPHA7Q15375 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
EPHA7Q15375 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
EPHA7Q15375 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
EPHA7Q15375 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
EPHA7Q15375 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
EPHA7Q15375 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
EPHA7Q15375 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
EPHA7Q15375 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
EPHA7Q15375 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
EPHA7Q15375 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
EPHA7Q15375 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
EPHA7Q15375 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
EPHA7Q15375 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
EPHA7Q15375 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
EPHA7Q15375 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
EPHA7Q15375 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
EPHA7Q15375 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
EPHA7Q15375 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
EPHA7Q15375 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
EPHA7Q15375 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
EPHA7Q15375 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
EPHA7Q15375 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
EPHA7Q15375 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
EPHA7Q15375 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
EPHA7Q15375 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
EPHA7Q15375 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EPHA7Q15375 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EPHA7Q15375 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EPHA7Q15375 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EPHA7Q15375 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
EPHA7Q15375 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms