RNA–Protein interactions for RNA: YLR407W

YLR407W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YLR407W, Length 687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR407W	YLR407W	MPS2	P53159	387 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR407W	YLR407W	COG7	P53195	279 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR407W	YLR407W	COS6	P53344	381 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR407W	YLR407W	YNR071C	P53757	342 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR407W	YLR407W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR407W	YLR407W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR407W	YLR407W	VHS1	Q03785	461 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR407W	YLR407W	HSP31	Q04432	237 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR407W	YLR407W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR407W	YLR407W	ARR3	Q06598	404 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR407W	YLR407W	SGT1	Q08446	395 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR407W	YLR407W	STT4	P37297	1900 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR407W	YLR407W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	STE3	P06783	470 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	OCA4	P25366	362 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	PPZ1	P26570	692 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	ATP7	P30902	174 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	SDH3	P33421	198 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	IST2	P38250	946 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	CYC2	P38909	366 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	YER010C	P40011	234 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	SER33	P40510	469 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	YIL001W	P40560	513 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	YFR018C	P43599	363 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	IRC7	P43623	340 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	MMT1	Q03218	510 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	ECM11	Q04110	302 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	SPC2	Q04969	178 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	TRI1	Q05024	226 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	RAD34	Q06665	692 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	GRS2	Q06817	618 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	ASA1	Q06822	443 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	NSE1	Q07913	336 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	MUM3	Q08750	479 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	TRM8	Q12009	286 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	DAP1	Q12091	152 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	PST1	Q12355	444 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	FAB1	P34756	2278 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	CCA1	P21269	546 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	YSR3	P23501	404 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	BUD14	P27637	709 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	CIN8	P27895	1000 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
YLR407W	YLR407W	AST1	P35183	429 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	ROT2	P38138	954 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	BMT2	P38278	337 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	YHR033W	P38690	423 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	FLO5	P38894	1075 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	CCT6	P39079	546 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	AYR1	P40471	297 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	PTR3	P43606	678 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	FMP33	P46998	180 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	GTO1	P48239	356 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	MDM34	P53083	459 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	YGL108C	P53139	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	GET1	P53192	235 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	YGR015C	P53208	328 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	ZRG17	P53735	605 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	TIM10	P87108	93 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	IRC15	Q02733	499 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	HOT1	Q03213	719 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	SNA4	Q07549	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	SRL1	Q08673	210 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	HUA2	Q12134	243 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	RUP1	Q12242	671 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	JLP1	Q12358	412 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	MHT1	Q12525	324 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	SUC2	P00724	532 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	HOM3	P10869	527 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	MRP13	P12686	339 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	YAK1	P14680	807 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	UGA1	P17649	471 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	URA4	P20051	364 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	ATP11	P32453	318 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	SOL2	P37262	315 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLR407W	YLR407W	UME6	P39001	836 aa		4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.9 ms