RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 ANO2Q9NQ90 1003 aa34.5■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 CLDND1Q9NY35 253 aa34.5■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 TRPV2Q9Y5S1 764 aa34.5■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa34.49■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 TSGA10IPQ3SY00 556 aa34.49■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 SDF4Q9BRK5 362 aa34.49■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 PLAGL2Q9UPG8 496 aa34.49■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 hCG_1984214I3L0E3 225 aa34.48■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 SREBF1P36956 1147 aa34.48■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 SLC26A2P50443 739 aa34.48■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 STAT5BP51692 787 aa34.48■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 NAALADL2Q58DX5 795 aa34.48■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 NPAS4Q8IUM7 802 aa34.48■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 NME8Q8N427 588 aa34.48■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 BRPF3Q9ULD4 1205 aa34.48■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 PADI3Q9ULW8 664 aa34.48■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 PIEZO1Q92508 2521 aa34.48■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 STXBP3O00186 592 aa34.47■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 NAPAP54920 295 aa34.47■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa34.47■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 NIPA1Q7RTP0 329 aa34.47■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 ADHFE1Q8IWW8 467 aa34.47■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 ANO3Q9BYT9 981 aa34.47■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 TRPC6Q9Y210 931 aa34.47■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa34.46■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 NEK1Q96PY6 1258 aa34.46■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 BARHL2Q9NY43 387 aa34.46■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 AP3B2Q13367 1082 aa34.45■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 RNF20Q5VTR2 975 aa34.45■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 MTHFD1LQ6UB35 978 aa34.45■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 CRYGNQ8WXF5 182 aa34.45■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 PGBD1Q96JS3 809 aa34.45■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 TMX1Q9H3N1 280 aa34.45■■■■□ 3.11
ALYREF-202ENST00000505490 CCNE2O96020 404 aa34.44■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 ADCY7P51828 1080 aa34.44■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 RCAN1P53805 252 aa34.44■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 RTN1Q16799 776 aa34.44■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 BMP2KLQ5H9B9 411 aa34.44■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 ABHD15Q6UXT9 468 aa34.44■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 GLT8D2Q9H1C3 349 aa34.44■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 V9GY48 417 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 M0QZ92 97 aa34.43■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 DCXO43602 365 aa34.43■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 DNAJB1P25685 340 aa34.43■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM62Q0P6H9 643 aa34.43■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 SPPL3Q8TCT6 385 aa34.43■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 SMCO2A6NFE2 343 aa34.42■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 DHX15O43143 795 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 ZBTB43O43298 467 aa34.42■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 TBX10O75333 385 aa34.42■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 ITGB1P05556 798 aa34.42■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 ADAM15Q13444 863 aa34.42■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 EP400NLQ6ZTU2 488 aa34.42■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 EVPLQ92817 2033 aa34.42■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 TRIOO75962 3097 aa34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 MBTPS2O43462 519 aa34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 STAG3L1P0CL83 205 aa34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 SCG2P13521 617 aa34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 KRT76Q01546 638 aa34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 PAK2Q13177 524 aa34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 RASEFQ8IZ41 740 aa34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 ATP8B4Q8TF62 1192 aa34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 COL1A2P08123 1366 aa34.4■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa34.4■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 HBP1O60381 514 aa34.4■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 ADCK5Q3MIX3 580 aa34.4■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 MSLNLQ96KJ4 702 aa34.4■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 TCEANC2Q96MN5 208 aa34.4■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 ERVK-5Q9HDB9 667 aa34.4■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM260Q9NX78 707 aa34.4■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 ZBTB42B2RXF5 422 aa34.39■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 FAM86B1E9PN63 330 aa34.39■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 CYP3A4P08684 503 aa34.39■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 FAM86B2P0C5J1 330 aa34.39■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 KLRC1P26715 233 aa34.39■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 CDC27P30260 824 aa34.39■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa34.39■■■■□ 3.1
ALYREF-202ENST00000505490 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa34.38■■■■□ 3.09
ALYREF-202ENST00000505490 LINC01565O15544 149 aa34.38■■■■□ 3.09
ALYREF-202ENST00000505490 IRS1P35568 1242 aa34.38■■■■□ 3.09
ALYREF-202ENST00000505490 KLHL23Q8NBE8 558 aa34.38■■■■□ 3.09
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF318Q5VUA4 2279 aa34.37■■■■□ 3.09
ALYREF-202ENST00000505490 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
ALYREF-202ENST00000505490 EYA4O95677 639 aa34.37■■■■□ 3.09
ALYREF-202ENST00000505490 ATP4AP20648 1035 aa34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms