RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W LSC1P53598 329 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YNR040WP53736 256 aa8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W CUZ1P53899 274 aa8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YNL058CP53947 316 aa8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W RDR1Q08904 546 aa8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W SLF1Q12034 447 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W SKS1Q12505 502 aa8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W SFG1Q12507 346 aa8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W HSC82P15108 705 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W AAC3P18238 307 aa8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YME1P32795 747 aa8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W JEM1P40358 645 aa8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YIL067CP40514 678 aa8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YPL071CQ02864 156 aa8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W SDC1Q03323 175 aa8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W DCR2Q05924 578 aa8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W GMC2Q06201 188 aa8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W FDH1Q08911 376 aa8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YDL211CQ12121 372 aa8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W Q0297Q9ZZV8 51 aa8.32□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W TRP3P00937 484 aa8.31□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W PET111P08468 800 aa8.31□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YHR214C-DP0CX93 97 aa8.31□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W BAR1P12630 587 aa8.31□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W CBS2P14905 389 aa8.31□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W PDA1P16387 420 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W RAD51P25454 400 aa8.31□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W CWH43P25618 953 aa8.31□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YSC84P32793 468 aa8.31□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W TIM10P87108 93 aa8.31□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YHR177WP38867 453 aa8.3□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W REE1P40893 198 aa8.3□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W FAR3P46671 204 aa8.3□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W URB2P47108 1174 aa8.3□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YNR068CP53754 272 aa8.3□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W SLM2P53955 656 aa8.3□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W NUR1Q12066 484 aa8.3□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W RPN5Q12250 445 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W SEC17P32602 292 aa8.29□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W SCS2P40075 244 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YGR066CP53242 292 aa8.29□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W MAL13P53338 473 aa8.29□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W INP1Q03694 420 aa8.29□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YDR124WQ04608 324 aa8.29□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W GPH1P06738 902 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W CBP6P07253 162 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YEF1P32622 495 aa8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W CAT2P32796 670 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W STP2P38704 541 aa8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W SEC31P38968 1273 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W SEN34P39707 275 aa8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W RIC1P40395 1056 aa8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YJR039WP47107 1121 aa8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W RPS12P48589 143 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W TAF6P53040 516 aa8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W RCF2P53721 224 aa8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W IDP3P53982 420 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W RPM2Q02773 1202 aa8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W NCE101Q02820 53 aa8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W VPS74Q06385 345 aa8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W NOP14Q99207 810 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YPR096CO13587 100 aa8.27□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W FLP1P03870 423 aa8.27□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W YAP1P19880 650 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W NFS1P25374 497 aa8.27□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W LYS12P40495 371 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W GTO1P48239 356 aa8.27□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W IRC15Q02733 499 aa8.27□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W VHS3Q08438 674 aa8.27□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W ATG34Q12292 412 aa8.27□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W ATP4P05626 244 aa8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W ARN2P38724 620 aa8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W ANS1P38832 159 aa8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W SHU2P38957 223 aa8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W YER010CP40011 234 aa8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W YEN1P40028 759 aa8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W ALG5P40350 334 aa8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W PFK26P40433 827 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W MRPS18P42847 217 aa8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W NOP19P53317 196 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W RNH70P53331 553 aa8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W UBX4P54730 416 aa8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W SWM1Q12379 170 aa8.26□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YLR349WYLR349W URA2P07259 2214 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.5 ms