RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566749.5

PPP4C-209, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,490 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-209	ENST00000566749	MBOAT7	Q96N66	472 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	RIT2	Q99578	217 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	GAS7	O60861	476 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	CKB	P12277	381 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	GUCY1B3	Q02153	619 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	SLC5A5	Q92911	643 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	TNFRSF25	Q93038	417 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	TMX3	Q96JJ7	454 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	TRPC6	Q9Y210	931 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	SAMM50	Q9Y512	469 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	SCN5A	Q14524	2016 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	SELP	P16109	830 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	RFC2	P35250	354 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	RBL2	Q08999	1139 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	WNT8B	Q93098	351 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	GJA10	Q969M2	543 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	ZNF302	Q9NR11	478 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	FAM205C	A6NFA0	338 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	FGB	P02675	491 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	SLC26A2	P50443	739 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	GRIK4	Q16099	956 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	LRCH3	Q96II8	777 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	SLC37A4	O43826	429 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	PSAP	P07602	524 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	THPO	P40225	353 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	ADAM17	P78536	824 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	PLCB4	Q15147	1175 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	WDR64	B1ANS9	1081 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	CHMP2A	O43633	222 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	PFKM	P08237	780 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	INSRR	P14616	1297 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	IGBP1	P78318	339 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	POTEB3	A0JP26	581 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	PSMD10	O75832	226 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	POTEB	Q6S5H4	581 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	27.83	■■■□□ 2.05	2e-10	■■■□□ 16.7
PPP4C-209	ENST00000566749	DISC1	Q9NRI5	854 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-209	ENST00000566749	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		27.83	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		27.83	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		27.83	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	VWCE	Q96DN2	955 aa		27.83	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		27.83	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	SFN	P31947	248 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	JAK3	P52333	1124 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	HERVK_113	Q902F9	699 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	KIF3A	Q9Y496	699 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	SZT2	Q5T011	3432 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	MARCH6	O60337	910 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	FAM20A	Q96MK3	541 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	HBP1	O60381	514 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	RSPH10B	P0C881	870 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	ACTN1	P12814	892 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	TET1	Q8NFU7	2136 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	CAND2	O75155	1236 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	RASIP1	Q5U651	963 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	POTED	Q86YR6	584 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	WDR81	Q562E7	1941 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-209	ENST00000566749	ZBBX	A8MT70	800 aa		27.78	■■■□□ 2.04

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