RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W SET3P36124 751 aa8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W YHB1P39676 399 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W DLD3P39976 496 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W CEP3P40969 608 aa8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W SHR5P41912 237 aa8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W APS3P47064 194 aa8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W DMA2P53924 522 aa8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W YLR460CP54007 376 aa8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W YPR091CQ06833 770 aa8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W YEH1Q07804 573 aa8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W YOR365CQ08844 703 aa8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data8.39□□□□□ -1.07not detected
YLR349WYLR349W MDM12Q92328 271 aa8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W TAD3Q9URQ3 322 aa8.39□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W ALG7P07286 448 aa8.38□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W SYP1P25623 870 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W HSP150P32478 413 aa8.38□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W SPO23P33757 523 aa8.38□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W YCR087C-AP37263 153 aa8.38□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W AST2P39945 430 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W MNN5P46982 586 aa8.38□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W PGU1P47180 361 aa8.38□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W IST1P53843 298 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W RHO4Q00246 291 aa8.38□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W YLR053CQ12026 108 aa8.38□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W YOS9Q99220 542 aa8.38□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W BPH1P25356 2167 aa8.37□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W DAT1P13483 248 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W YIM1P28625 365 aa8.37□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W MDJ1P35191 511 aa8.37□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data8.37□□□□□ -1.07not detected
YLR349WYLR349W REV7P38927 245 aa8.37□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W AIM2P39721 246 aa8.37□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W SOK1P40317 901 aa8.37□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W AIM22P47051 409 aa8.37□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W GTR2P53290 341 aa8.37□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W PLM2Q04383 521 aa8.37□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W ILV2P07342 687 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W ADH4P10127 382 aa8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W ARF1P11076 181 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W MCK1P21965 375 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W OCA4P25366 362 aa8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W APD1P38281 316 aa8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W TDP1P38319 544 aa8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W MID1P41821 548 aa8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W MAD3P47074 515 aa8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W SMA2Q04658 369 aa8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W FAR10Q06001 478 aa8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W YPR172WQ06608 200 aa8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W RSA1Q08932 381 aa8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W GET4Q12125 312 aa8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W NTO1Q12311 748 aa8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W PSF1Q12488 208 aa8.36□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W ERD1P16151 362 aa8.35□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W DPB3P27344 201 aa8.35□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W SSO1P32867 290 aa8.35□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W TPO5P36029 618 aa8.35□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W FAD1P38913 306 aa8.35□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W SMX2P40204 77 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W PRY1P47032 299 aa8.35□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W KEL2P50090 882 aa8.35□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W HOS2P53096 452 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W MON1P53129 644 aa8.35□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W PUN1Q06991 263 aa8.35□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W FRA1Q07825 749 aa8.35□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W YOL019WQ08157 551 aa8.35□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W CDC8P00572 216 aa8.34□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W RHO2P06781 192 aa8.34□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W YEL043WP32618 956 aa8.34□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W COS111P38308 924 aa8.34□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W HSM3P38348 480 aa8.34□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W PTH1P38876 190 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W MET18P40469 1032 aa8.34□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W PSA1P41940 361 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W USA1Q03714 838 aa8.34□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa8.34□□□□□ -1.07
YLR349WYLR349W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W CTA1P15202 515 aa8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W NCP1P16603 691 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W RPB5P20434 215 aa8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W RPI1P23250 407 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W MEF1P25039 761 aa8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W LOT5P34234 306 aa8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W RIM2P38127 377 aa8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W MAL32P38158 584 aa8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YMR262WP38430 313 aa8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W YGP1P38616 354 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W GAT2P40209 560 aa8.33□□□□□ -1.08
YLR349WYLR349W PTR3P43606 678 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.1 ms