RNA–Protein interactions for RNA: YJL089W

SIP4, Transcript of C6 zinc cluster transcriptional activator, yeast

Gene SIP4, Length 2,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP4	YJL089W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	NPP1	P25353	742 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	CPR3	P25719	182 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	HEM3	P28789	327 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	FUN30	P31380	1131 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	LYP1	P32487	611 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	MKK1	P32490	508 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	NUP120	P35729	1037 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YBR139W	P38109	508 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	RIM2	P38127	377 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	BZZ1	P38822	633 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YHR210C	P38893	341 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YJL206C	P39529	758 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YEN1	P40028	759 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	FKH2	P41813	862 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	MDV1	P47025	714 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	AAD10	P47182	288 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	TIS11	P47977	285 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	ZIP2	P53061	704 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YNL140C	P53910	189 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	AAT1	Q01802	451 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YPL071C	Q02864	156 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YMR155W	Q03795	547 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	STE23	Q06010	1027 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	CRN1	Q06440	651 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	RAD34	Q06665	692 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	REH1	Q06709	432 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	REX4	Q08237	289 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YOR365C	Q08844	703 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	MMT2	Q08970	484 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YOR342C	Q12182	319 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	RUP1	Q12242	671 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SPE4	Q12455	300 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	MDM12	Q92328	271 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YOR019W	Q99248	730 aa		1.09	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YPR096C	O13587	100 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	RHO2	P06781	192 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	APN1	P22936	367 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	OCA4	P25366	362 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	TRX3	P25372	127 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	AAD3	P25612	363 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	ATG15	P25641	520 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	NAM9	P27929	486 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	MSN2	P33748	704 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SPO23	P33757	523 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YOR062C	P36025	268 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	FRE2	P36033	711 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	MIA40	P36046	403 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	VPS51	P36116	164 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	CAF4	P36130	643 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	BET3	P36149	193 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	APT2	P36973	181 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	BNA4	P38169	460 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	PHO89	P38361	574 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	RPS27B	P38711	82 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YIL152W	P40455	235 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	PKP1	P40530	394 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	PAC11	P40960	533 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.08	□□□□□ -2.24	not detected
SIP4	YJL089W	FAR3	P46671	204 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	AIM22	P47051	409 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	URB2	P47108	1174 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	BUL1	P48524	976 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SAM37	P50110	327 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YGL260W	P53056	76 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	ROG1	P53118	685 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	RPN14	P53196	417 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	BIO4	P53630	237 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	BSC5	P53755	489 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YNL092W	P53934	400 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	FDC1	Q03034	503 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YMR209C	Q03648	457 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	TAF12	Q03761	539 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	NUP53	Q03790	475 aa		1.08	□□□□□ -2.24

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