RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W LDB17Q12342 491 aa3.75□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W GSC2P40989 1895 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RAD10P06838 210 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W PUT2P07275 575 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W GRX2P17695 143 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W CKA2P19454 339 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W LAC1P28496 418 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W NUP2P32499 720 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W PXA2P34230 853 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W BLI1P35727 113 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W TEF4P36008 412 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W CIN1P40987 1014 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YGR079WP53249 370 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W COG5P53951 403 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W DBP9Q06218 594 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YLL007CQ07799 665 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YLR053CQ12026 108 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W HER1Q12276 1246 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RTR2Q12378 196 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W GTT2Q12390 233 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W ATG31Q12421 196 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W HKR1P41809 1802 aa3.74□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W COX1P00401 534 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W ATP2P00830 511 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YGL041W-AP0C5N3 154 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W DBF2P22204 572 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W TFC1P32367 649 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W TAF14P35189 244 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W NAT2P37293 288 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W MMS21P38632 267 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RRF1P38771 230 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W UTP9P38882 575 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W FRT2P39734 528 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YJR061WP40355 935 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W MSS2P40990 351 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YGR210CP42942 411 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W ZAP1P47043 880 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W ORC5P50874 479 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W CGR1P53188 120 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YTP1P53584 459 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YMR010WQ03687 405 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YET2Q04210 160 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YMR018WQ04364 514 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W THI20Q08224 551 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W SNF4P12904 322 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W GAL3P13045 520 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RCY1P39531 840 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YJL070CP40361 888 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W CPR7P47103 393 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W CAF40P53829 373 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W STP1Q00947 519 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YMR027WQ04371 470 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W SPC2Q04969 178 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W FMP45Q07651 309 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W MED2Q12124 431 aa3.73□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RHO1P06780 209 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W NFT1P0CE68 1218 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W CMK2P22517 447 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RVS161P25343 265 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W DBF4P32325 704 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W GSH1P32477 678 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W SLX1P38324 304 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W EDC3P39998 551 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W JLP2P40206 208 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W ASG1P40467 964 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YFL040WP43562 540 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W NAS6P50086 228 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W GLO1P50107 326 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W SCS3P53012 380 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W BNA7Q04066 261 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W BLS1Q06071 122 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W PGC1Q08959 321 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YPR022CQ12139 1133 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W APA1P16550 321 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W NCP1P16603 691 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YSP3P25036 478 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YCL049CP25577 312 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W VMA6P32366 345 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YRB2P40517 327 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W BIO4P53630 237 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W MPS1P54199 764 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YDR109CQ04585 715 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YDR222WQ04925 415 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W VTA1Q06263 330 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W SHS1Q07657 551 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data3.72□□□□□ -1.81not detected
HCA4YJL033W LOT6Q07923 191 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W CRC1Q12289 327 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W SPE4Q12455 300 aa3.72□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W SAR1P20606 190 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
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