RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6V0A1Q93050 837 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 IGSF1Q8N6C5 1336 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ROBO2Q9HCK4 1378 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 KCNJ18B7U540 433 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 RGL2O15211 777 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ATF2P15336 505 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 NEK2P51955 445 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 STX17P56962 302 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 GCKRQ14397 625 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 KCNJ12Q14500 433 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 MAPK6Q16659 721 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 BBS5Q8N3I7 341 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 RSPH1Q8WYR4 309 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 FMO2Q99518 471 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 NACA2Q9H009 215 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PARVBQ9HBI1 364 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 RAB20Q9NX57 234 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SNX14Q9Y5W7 946 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 MYO3BQ8WXR4 1341 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CARNS1A5YM72 827 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CDK17Q00537 523 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SLC39A14Q15043 492 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 FOXR2Q6PJQ5 311 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 FKBP9P1Q75LS8 142 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SGSM3Q96HU1 749 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 KIF13AQ9H1H9 1805 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 MUTP22033 750 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 HADHAP40939 763 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 FOSBP53539 338 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ELF2Q15723 593 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ATAD3BQ5T9A4 648 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PQJ5 194 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 RPS6KA4O75676 772 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PYGLP06737 847 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SMARCA1P28370 1054 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SLC1A1P43005 524 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PSMC4P43686 418 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 STX1BP61266 288 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 AP1B1Q10567 949 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PICALMQ13492 652 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 VSTM4Q8IW00 320 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 MYOCDQ8IZQ8 938 aa5.3□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 EPSTI1Q96J88 318 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 FNBP1Q96RU3 617 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 GIMAP4Q9NUV9 329 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 STX8Q9UNK0 236 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CPS1P31327 1500 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 XDHP47989 1333 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF521Q96K83 1311 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ADGRA2Q96PE1 1338 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 KPNA7A9QM74 516 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 RIMBP2O15034 1052 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 MCF2P10911 925 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 DEFA1P59665 94 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 DEFA3P59666 94 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 MORC3Q14149 939 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TTC17Q96AE7 1141 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF653Q96CK0 615 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 HAUS7Q99871 368 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ECT2Q9H8V3 914 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa5.3□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 NR1D1P20393 614 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CHRNA3P32297 505 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SESN3P58005 492 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CALCRLQ16602 461 aa5.3□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 HORMAD1Q86X24 394 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 NELFBQ8WX92 580 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC17Q96LX7 622 aa5.3□□□□□ -1.56
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