RNA–Protein interactions for RNA: YJL198W

PHO90, Transcript of Low-affinity phosphate transporter, yeast

Gene PHO90, Length 2,646 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PHO90	YJL198W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	AGP3	P43548	558 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	NUP85	P46673	744 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MNN5	P46982	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YJL045W	P47052	634 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SOL4	P53315	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SPO77	Q06134	477 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CDA2	Q06703	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	ULA1	Q12059	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	BMT6	Q12291	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PRC1	P00729	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CDC23	P16522	626 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MAK31	P23059	88 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SFA1	P32771	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RGT1	P32862	1170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RIM2	P38127	377 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SIF2	P38262	535 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	OSH7	P38755	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	GLG2	P47011	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CPR7	P47103	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MRX6	P48564	524 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SPT20	P50875	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SAP4	P53036	818 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MND1	P53102	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SGF73	P53165	657 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
PHO90	YJL198W	CPR8	P53728	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	STP1	Q00947	519 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	TVP15	Q03860	143 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	STP4	Q07351	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MNE1	P24720	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YCR101C	P25607	182 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
PHO90	YJL198W	HYM1	P32464	399 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	FRE1	P32791	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	STV1	P37296	890 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	BZZ1	P38822	633 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	EXO1	P39875	702 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	FMP52	P40008	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	GTT1	P40582	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	AIM23	P47015	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	INN1	P53901	409 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YSA1	Q01976	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MAK3	Q03503	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CYK3	Q07533	885 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	XYL2	Q07993	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SCP1	Q08873	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	LAG2	Q92325	660 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	ABF1	P14164	731 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PRP28	P23394	588 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CPR3	P25719	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MRPL37	P36532	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CHK1	P38147	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SER2	P42941	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	APC4	Q04601	652 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SKM1	Q12469	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	TIM9	O74700	87 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	AAC1	P04710	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RSC6	P25632	483 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	ADK2	P26364	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	APN2	P38207	520 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MLH1	P38920	769 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	NAS2	P40555	220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YFL052W	P43551	465 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	IDS2	P46958	469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	JAC1	P53193	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RET3	P53600	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PFA5	Q03289	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	ESA1	Q08649	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MED11	Q99278	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	ISN1	Q99312	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SAS5	Q99314	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	HIS5	P07172	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CAP2	P13517	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	AFT1	P22149	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	GIT1	P25346	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RPD3	P32561	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 414.6 ms