RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	VPS13	Q07878	3144 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PEX18	YHR160C	OPI1	P21957	404 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	NDI1	P32340	513 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	ATP11	P32453	318 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	BTN2	P53286	410 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	CAF40	P53829	373 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	MRPL35	Q06678	367 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	RAD61	Q99359	647 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	TUS1	Q06412	1307 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	GAL80	P04387	435 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	CLN3	P13365	580 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.01	□□□□□ -1.93	not detected
PEX18	YHR160C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.01	□□□□□ -1.93	not detected
PEX18	YHR160C	MYO3	P36006	1272 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	CST26	P38226	397 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	MTC6	P38849	526 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	SYG1	P40528	902 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	TIS11	P47977	285 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	YLR422W	Q06409	1932 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	AAC3	P18238	307 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	CPR4	P25334	318 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	PAH1	P32567	862 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	ANP1	P32629	500 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	RSM22	P36056	628 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	NAT2	P37293	288 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	YGR210C	P42942	411 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	MRX6	P48564	524 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	GOR1	P53839	350 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	MFB1	Q04922	465 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	VPS38	Q05919	439 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	MHR1	Q06630	226 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	ESA1	Q08649	445 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	HRT3	Q12347	344 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	PEP3	P27801	918 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	IMP2'	P32351	346 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	HXT1	P32465	570 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	ERP2	P39704	215 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	POP1	P41812	875 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	SDT1	P53078	280 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	RRN11	Q04712	507 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	SUE1	Q06524	206 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	MAK31	P23059	88 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	REG2	P38232	338 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	MUM2	P38236	366 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	POP6	P53218	158 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	SLG1	P54867	378 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	FIN1	Q03898	291 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	RCN2	Q12044	265 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	AVL9	Q12500	764 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	SEM1	O94742	89 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	CBS1	P14066	229 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	YCR100C	P25606	316 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	VAB2	P40003	282 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	TOF1	P53840	1238 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
PEX18	YHR160C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.97	□□□□□ -1.93	not detected
PEX18	YHR160C	SRO77	P38163	1010 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	REE1	P40893	198 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	EPL1	P43572	832 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	TRS85	P46944	698 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	YLR152C	P54072	576 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	RBD2	Q12270	262 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	FAB1	P34756	2278 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	SPR1	P32603	445 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	VPS45	P38932	577 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	PES4	P39684	611 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	TMA108	P40462	946 aa		2.95	□□□□□ -1.94

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