RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	COG3	P40094	801 aa		7.88	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	SDT1	P53078	280 aa		7.88	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	PRM8	P53174	237 aa		7.88	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	SPO77	Q06134	477 aa		7.88	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	FMP45	Q07651	309 aa		7.88	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	YLR036C	Q07986	203 aa		7.88	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	SFM1	Q12314	213 aa		7.88	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	TRM10	Q12400	293 aa		7.88	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	MPD2	Q99316	277 aa		7.88	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	CTS1	P29029	562 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	SSO1	P32867	290 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	SEC66	P33754	206 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	NUF2	P33895	451 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	YPK3	P38070	525 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	IPT1	P38954	527 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	SPO73	P40031	143 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	AIM20	P40451	204 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	APQ12	P40532	138 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	AZF1	P41696	914 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	TY4A-J	P47023	414 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	BIO3	P50277	480 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	AQR1	P53943	586 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	OAZ1	Q02803	292 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	NTG2	Q08214	380 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	YPL191C	Q08930	360 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	SUL2	Q12325	893 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	INH1	P01097	85 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	MER1	P16523	270 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	RHB1	P25378	209 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	RAD51	P25454	400 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	DOM34	P33309	386 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	KKQ8	P36004	724 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	MAD2	P40958	196 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	YFR020W	P43600	232 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	YNL181W	P53878	407 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	PLB3	Q08108	686 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	YOR389W	Q08912	624 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	HAL9	Q12180	1030 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		7.87	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	TAO3	P40468	2376 aa		7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	ALG7	P07286	448 aa		7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	MAC1	P35192	417 aa		7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	STP2	P38704	541 aa		7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	GDH3	P39708	457 aa		7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	SWP82	P43554	623 aa		7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	PAC10	P48363	199 aa		7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	SNF12	P53628	566 aa		7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	PUN1	Q06991	263 aa		7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	TEN1	Q07921	160 aa		7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	YLR126C	Q12288	251 aa		7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	TSC13	Q99190	310 aa		7.86	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	RRN10	P38204	145 aa		7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	YGR201C	P42936	225 aa		7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	YFL066C	P43538	392 aa		7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	EFM3	P47163	339 aa		7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	ROM1	P53046	1155 aa		7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	NPY1	P53164	384 aa		7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	SGF73	P53165	657 aa		7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	YKR005C	Q02203	525 aa		7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	GAL83	Q04739	417 aa		7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	OPI10	Q08202	246 aa		7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	YCL049C	P25577	312 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	LOT5	P34234	306 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	ATG14	P38270	344 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	SOK1	P40317	901 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	SSU1	P41930	458 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	ROT1	Q03691	256 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	TRM82	Q03774	444 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	NEJ1	Q06148	342 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	MRX4	Q12467	430 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	MDM35	O60200	86 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	PUT2	P07275	575 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	ENA1	P13587	1091 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	BET2	P20133	325 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	APT2	P36973	181 aa		7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
GGA2	YHR108W	SCO2	P38072	301 aa		7.84	□□□□□ -1.15

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