RNA–Protein interactions for RNA: YOR054C

VHS3, Transcript of Negative regulatory subunit of protein phosphatase 1 Ppz1p, yeast

Gene VHS3, Length 2,025 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHS3	YOR054C	SWI5	P08153	709 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
VHS3	YOR054C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	FUN26	P31381	517 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	NDC1	P32500	655 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	ORC2	P32833	620 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	SPO23	P33757	523 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	TFA2	P36145	328 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	APN2	P38207	520 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	ARN1	P38731	627 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	NEM1	P38757	446 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	LYS9	P38999	446 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	RMD6	P39975	231 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	ICP55	P40051	511 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	IDS2	P46958	469 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	YJL043W	P47053	257 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	VTC4	P47075	721 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	MTO1	P53070	669 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	POP6	P53218	158 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	RSM27	P53305	110 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	HHO1	P53551	258 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	INN1	P53901	409 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	VPS9	P54787	451 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	YPL071C	Q02864	156 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	AIM36	Q03798	255 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	PLM2	Q04383	521 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	TPO1	Q07824	586 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	DSE3	Q08729	430 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	YLL058W	Q12198	575 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	MHF1	Q3E835	90 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	RGS2	Q99188	309 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	REP2	P03872	296 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
VHS3	YOR054C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	RHO2	P06781	192 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	MAS1	P10507	462 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	PET54	P10834	293 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	INO1	P11986	533 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	CHS2	P14180	963 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	AMD2	P22580	549 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	ERG9	P29704	444 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	ATP11	P32453	318 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	IST2	P38250	946 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	POP7	P38291	140 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	SAP30	P38429	201 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	PPE1	P38796	400 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	RBG1	P39729	369 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	FMP52	P40008	231 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	SCC4	P40090	624 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	COX16	P47081	118 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	TAH11	P47112	604 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	RTA1	P53047	317 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	SPR6	Q01684	191 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	TIM44	Q01852	431 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	NUP49	Q02199	472 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	SMA1	Q02651	245 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	KAP120	Q02932	1032 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	PPN1	Q04119	674 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	YDR387C	Q04162	555 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	TRM12	Q04235	462 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	BCH1	Q05029	724 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	YLR283W	Q05867	314 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	GAS5	Q08193	484 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	PUS9	Q12069	462 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	ERP4	Q12450	207 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	KCS1	Q12494	1050 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	YOR019W	Q99248	730 aa		3.97	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	FLO1	P32768	1537 aa		3.96	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	AAC1	P04710	309 aa		3.96	□□□□□ -1.78
VHS3	YOR054C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
VHS3	YOR054C	MGR1	P25573	417 aa		3.96	□□□□□ -1.78
VHS3	YOR054C	CHS3	P29465	1165 aa		3.96	□□□□□ -1.78
VHS3	YOR054C	LDS1	P31379	325 aa		3.96	□□□□□ -1.78
VHS3	YOR054C	PHA2	P32452	334 aa		3.96	□□□□□ -1.78
VHS3	YOR054C	SCM4	P32564	187 aa		3.96	□□□□□ -1.78
VHS3	YOR054C	SFA1	P32771	386 aa		3.96	□□□□□ -1.78
VHS3	YOR054C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
VHS3	YOR054C	LDH1	P38139	375 aa		3.96	□□□□□ -1.78
VHS3	YOR054C	CHK1	P38147	527 aa		3.96	□□□□□ -1.78

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