RNA–Protein interactions for RNA: YOR032C

HMS1, Transcript of bHLH protein with similarity to myc-family transcription factors, yeast

Gene HMS1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS1	YOR032C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	FRE2	P36033	711 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	YND1	P40009	630 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	VHS2	P40463	436 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	EFM4	P40516	257 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	ECM27	P47144	725 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	TOM22	P49334	152 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	PNG1	Q02890	363 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	BUG1	Q12191	341 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	SCEI	P03882	235 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	PUP2	P32379	260 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	ECM25	P32525	599 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	PTR2	P32901	601 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	SWH1	P35845	1188 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	PCP1	P53259	346 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	OCA2	P53949	197 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	MPS1	P54199	764 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	CDC23	P16522	626 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	RRN10	P38204	145 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	TRS85	P46944	698 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	GWT1	P47026	490 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	SOR2	Q07786	357 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	REX4	Q08237	289 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	CYB2	P00175	591 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	YCR100C	P25606	316 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	DPH2	P32461	534 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	NDC1	P32500	655 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	HEL1	P36113	551 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	SHO1	P40073	367 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	SCS3	P53012	380 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	YIP1	P53039	248 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	NUP53	Q03790	475 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	SPT7	P35177	1332 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	PDE2	P06776	526 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	PMR1	P13586	950 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	YCR041W	P37265	110 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	HAT2	P39984	401 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	PHO86	P46956	311 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	EOS1	P53938	366 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	ODC1	Q03028	310 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	GRS2	Q06817	618 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	NDI1	P32340	513 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	FAD1	P38913	306 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	ALG8	P40351	577 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	YJL070C	P40361	888 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	RTT101	P47050	842 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	TAF12	Q03761	539 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	MUM3	Q08750	479 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	MRS3	P10566	314 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	YCR022C	P25620	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	SPC110	P32380	944 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	PCA1	P38360	1216 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
HMS1	YOR032C	HMS2	P47175	358 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	PIB2	P53191	635 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	PPM1	Q04081	328 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	DAP1	Q12091	152 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	FRE6	Q12473	712 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	SKS1	Q12505	502 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HMS1	YOR032C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	ATR1	P13090	542 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	CAJ1	P39101	391 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	MLC1	P53141	149 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	FRE4	P53746	719 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76

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