RNA–Protein interactions for RNA: YOL050C

YOL050C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YOL050C, Length 321 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOL050C	YOL050C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	ODC1	Q03028	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	ACL4	Q03771	387 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	AIM32	Q04689	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	BEM1	P29366	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	TFB1	P32776	642 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	ZIM17	P42844	174 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	ECM27	P47144	725 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	AVT4	P50944	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	YIP1	P53039	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	PCP1	P53259	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	MMR1	Q06324	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	HIP1	P06775	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	HOM3	P10869	527 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	RHB1	P25378	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	YCR041W	P37265	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	SLM4	P38247	162 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	RRT2	P38332	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	TOM22	P49334	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	HOT1	Q03213	719 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	PHO2	P07269	559 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
YOL050C	YOL050C	URA4	P20051	364 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	AGA1	P32323	725 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	PXA2	P34230	853 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	YHR054C	P38780	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	IDP2	P41939	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	RSC1	P53236	928 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	PIR3	Q03180	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	SCEI	P03882	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	CLN1	P20437	546 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	BRF1	P29056	596 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	POP6	P53218	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	RTT103	Q05543	409 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	MED2	Q12124	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YOL050C	YOL050C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	MMS4	P38257	691 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	CAF40	P53829	373 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	CIK1	Q01649	594 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	TAF12	Q03761	539 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	DCS1	Q06151	350 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	SOR2	Q07786	357 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	PMR1	P13586	950 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	CTR86	P25355	563 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
YOL050C	YOL050C	KRE9	P39005	276 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
YOL050C	YOL050C	WSC2	P53832	503 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	MRP51	Q02950	344 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	HNT3	Q08702	217 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	UAF30	Q08747	228 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	BUG1	Q12191	341 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	ORT1	Q12375	292 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	MST28	P39552	234 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	SER3	P40054	469 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	PHO86	P46956	311 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	YJL132W	P47014	750 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	SSN8	P47821	323 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	YGR111W	P53265	400 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	YNR048W	P53740	393 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	VPS9	P54787	451 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	MUM3	Q08750	479 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	RMD5	Q12508	421 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	CHS1	P08004	1131 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	SPO7	P18410	259 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	ITR1	P30605	584 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	PEX5	P35056	612 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	YAL037W	P39728	267 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	FRE4	P53746	719 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	SGT1	Q08446	395 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	VPS54	Q12071	889 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YOL050C	YOL050C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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