RNA–Protein interactions for RNA: YMR032W

HOF1, Transcript of SH3 domain-containing protein required for cytokinesis, yeast

Gene HOF1, Length 2,010 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOF1	YMR032W	AIM41	Q12032	185 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
HOF1	YMR032W	ECM3	Q99252	613 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	RAD3	P06839	778 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	HXT2	P23585	541 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	POP7	P38291	140 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	ALP1	P38971	573 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	GET2	P40056	285 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	AGE2	P40529	298 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	YNL260C	P53846	198 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	YNL181W	P53878	407 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	HOF1	Q05080	669 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
HOF1	YMR032W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	ALG1	P16661	449 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	PTC6	P25646	442 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	DOA1	P36037	715 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	CHK1	P38147	527 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	SBE22	P38814	852 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	BUR6	P40096	142 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	SWP82	P43554	623 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	YAR1	P46683	200 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	IDS2	P46958	469 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	COX18	P53239	316 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	MRP51	Q02950	344 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	YDR222W	Q04925	415 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	SEC10	Q06245	871 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	MRPL35	Q06678	367 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	REX4	Q08237	289 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
HOF1	YMR032W	POM34	Q12445	299 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	ZPS1	Q12512	249 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HOF1	YMR032W	YLR415C	O13578	112 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	CMK2	P22517	447 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	DCG1	P32460	244 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YBR144C	P34215	104 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	ECM1	P39715	212 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	PIG2	P40187	538 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YFL066C	P43538	392 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	JJJ3	P47138	172 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	IBA57	P47158	497 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	MRPS35	P53292	345 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	EFM6	P53970	246 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	FMP30	Q02883	468 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	USA1	Q03714	838 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YMR160W	Q03823	816 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	ARR3	Q06598	404 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	VAM3	Q12241	283 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	COX2	P00410	251 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	PRR1	P28708	518 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	RPC25	P35718	212 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YBR259W	P38338	688 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	PCA1	P38360	1216 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YJL206C	P39529	758 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	HXT9	P40885	567 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	HXT11	P54862	567 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	IPK1	Q06667	281 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	PAM18	Q07914	168 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	COX3	P00420	269 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	AI3	P03877	415 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	ERG11	P10614	530 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	RHB1	P25378	209 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	LDB7	P38210	180 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	PTC7	P38797	343 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	PLB1	P39105	664 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	UBX6	P47049	396 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	RFX1	P48743	811 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	DIP5	P53388	608 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YDR541C	Q03049	344 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YDL176W	Q12027	708 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	SPO24	Q3E752	67 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	PUT2	P07275	575 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	PMR1	P13586	950 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	CHS2	P14180	963 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	CBF1	P17106	351 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	MRPL8	P22353	238 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	KIN82	P25341	720 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	RIB1	P38066	345 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	ARA1	P38115	344 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	APD1	P38281	316 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HOF1	YMR032W	YHR210C	P38893	341 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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