RNA–Protein interactions for RNA: YGR110W

CLD1, Transcript of Mitochondrial cardiolipin-specific phospholipase, yeast

Gene CLD1, Length 1,338 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLD1	YGR110W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	CDC25	P04821	1589 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	SPO7	P18410	259 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	OPI1	P21957	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	GYP6	P32806	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	MMS4	P38257	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	YHR054C	P38780	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	YTA12	P40341	825 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	YGL082W	P53155	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	IRC15	Q02733	499 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	SCC2	Q04002	1493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	DNF1	P32660	1571 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	BNI1	P41832	1953 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	CBP4	P37267	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	SOR2	Q07786	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	HSP42	Q12329	375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	YPK9	Q12697	1472 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	COX3	P00420	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	MRS3	P10566	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	CDC23	P16522	626 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	ATS1	P31386	333 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	LTV1	P34078	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	FRE2	P36033	711 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	HEL1	P36113	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	TRS85	P46944	698 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	IKS1	P47042	667 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	PCP1	P53259	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	PEX25	Q02969	394 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	AFT2	Q08957	416 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	AEP3	Q12089	606 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	RPO31	P04051	1460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	REC114	P32841	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	RIM2	P38127	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	PCA1	P38360	1216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	VHS2	P40463	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	TOM22	P49334	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	DSL1	P53847	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	ARK1	P53974	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	EXO70	P19658	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	PAN1	P32521	1480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	RKR1	Q04781	1562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	MTR10	Q99189	972 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLD1	YGR110W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	ECM25	P32525	599 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	FAD1	P38913	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	HAT2	P39984	401 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	GWT1	P47026	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	VPS74	Q06385	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	SCEI	P03882	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	YCR041W	P37265	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	BZZ1	P38822	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	MPS1	P54199	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	FRE6	Q12473	712 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	YCR100C	P25606	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	PUP2	P32379	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	NDC1	P32500	655 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	PTR2	P32901	601 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	SHO1	P40073	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	GCD10	P41814	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	PHO86	P46956	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	YIP1	P53039	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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