RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 FFAR3O14843 346 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 PLD2O14939 933 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 ATF2P15336 505 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 FBLN1P23142 703 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 MC3RP41968 323 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 USP53Q70EK8 1073 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 LZTR1Q8N653 840 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 DCAF4Q8WV16 495 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 ALG3Q92685 438 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 KCNQ2O43526 872 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 RFPL3O75679 317 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 GLI4P10075 376 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 LTBRP36941 435 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 GABREP78334 506 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 KCNAB2Q13303 367 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 MBLAC2Q68D91 279 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 IQCEQ6IPM2 695 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 STYK1Q6J9G0 422 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 CXorf38Q8TB03 319 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 USP33Q8TEY7 942 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 PTPRN2Q92932 1015 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 GULP1Q9UBP9 304 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GTL3 188 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 CLSTN1O94985 981 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 ASGR2P07307 311 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 NCAM1P13591 858 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 KCNC1P48547 511 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 INF2Q27J81 1249 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 DIO2Q92813 273 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 RNF38Q9H0F5 515 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 GPR27Q9NS67 375 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-204ENST00000542443 ASXL2Q76L83 1435 aa7.15□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.15□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 RAPGEF3O95398 923 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 SLURP1P55000 103 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 C7orf72A4D263 438 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 EFCAB14O75071 495 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 CELA3BP08861 270 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 LCP1P13796 627 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 PMLP29590 882 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 GYS2P54840 703 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 NINJ1Q92982 152 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 PEX11GQ96HA9 241 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 TEPSINQ96N21 525 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 PLAAQ9Y263 795 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 FUCA1P04066 466 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 CAP1Q01518 475 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 VWA3BQ502W6 1294 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 SPATA25Q9BR10 227 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 MTA3Q9BTC8 594 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 AQP7O14520 342 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 NPHS1O60500 1241 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 MSCO60682 206 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 GPR85P60893 370 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.4 ms