RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476842.1

SMIM4-202, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SMIM4, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-202ENST00000476842 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 GPRASP2Q96D09 838 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 JADE2Q9NQC1 790 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 GJB4Q9NTQ9 266 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 A6NJR5 290 aa20.32■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 CPT1AP50416 773 aa20.32■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 ARHGAP4P98171 946 aa20.32■□□□□ 0.84
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SMIM4-202ENST00000476842 SEMA3FQ13275 785 aa20.32■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 LAMC2Q13753 1193 aa20.32■□□□□ 0.84
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SMIM4-202ENST00000476842 CDHR1Q96JP9 859 aa20.32■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.32■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 CEP55Q53EZ4 464 aa20.31■□□□□ 0.84
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SMIM4-202ENST00000476842 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.31■□□□□ 0.84
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SMIM4-202ENST00000476842 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 A0A1W2PQY0 241 aa20.3■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 MEIS1O00470 390 aa20.3■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 KPNA6O60684 536 aa20.3■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 CABYRO75952 493 aa20.3■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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SMIM4-202ENST00000476842 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.3■□□□□ 0.84
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SMIM4-202ENST00000476842 ELP1O95163 1332 aa20.29■□□□□ 0.84
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SMIM4-202ENST00000476842 USP11P51784 963 aa20.29■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 MTMR1Q13613 665 aa20.29■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 TRIM29Q14134 588 aa20.29■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.29■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.29■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.29■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.29■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 AFG1LQ8WV93 481 aa20.29■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.29■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.29■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 EDIL3O43854 480 aa20.28■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 ATP9AO75110 1047 aa20.28■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 CIITAP33076 1130 aa20.28■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.28■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 KRT40Q6A162 431 aa20.28■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.28■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.28■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 PPTC7Q8NI37 304 aa20.28■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 OXER1Q8TDS5 423 aa20.28■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 TBCKQ8TEA7 893 aa20.28■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 DPF3Q92784 378 aa20.28■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.28■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.28■□□□□ 0.84
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SMIM4-202ENST00000476842 FAM86B1E9PN63 330 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 MMP1P03956 469 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 KRT2P35908 639 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 SNX17Q15036 470 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 METTL7BQ6UX53 244 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 C8orf76Q96K31 380 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 SPATA33Q96N06 139 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM4-202ENST00000476842 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.27■□□□□ 0.84
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SMIM4-202ENST00000476842 MMP3P08254 477 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 MYL3P08590 195 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 ARP10275 920 aa20.26■□□□□ 0.83
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SMIM4-202ENST00000476842 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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SMIM4-202ENST00000476842 EVI5O60447 810 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 SNX21Q969T3 373 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 KIF3AQ9Y496 699 aa20.25■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 BTBD18B2RXH4 712 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 SORBS3O60504 671 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM4-202ENST00000476842 CYP3A7P24462 503 aa20.24■□□□□ 0.83
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