RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)D

tK(UUU)D, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)D, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)DtK(UUU)D MDM30Q05930 598 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D YPR172WQ06608 200 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D YOL019WQ08157 551 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D NOB1Q08444 459 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D GYP1Q08484 637 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D YLR049CQ12110 428 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D UPC2Q12151 913 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D YPL066WQ12194 479 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D RPN5Q12250 445 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D PNS1Q12412 539 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D HOP09932 586 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2A-LR1P0C2J4 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D COS2P0CX12 379 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D COS3P0CX13 379 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2A-FP0CX61 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2A-GR2P0CX62 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D BAS1P22035 811 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D RPB10P22139 70 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D AGP1P25376 633 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D CHA1P25379 360 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2A-CP25383 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D TAH1P25638 111 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D RPC19P28000 142 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D CTS1P29029 562 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D SUI1P32911 108 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D FRE2P36033 711 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D CTP1P38152 299 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D YHR210CP38893 341 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D PAC1P39946 494 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D ARB1P40024 610 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D NEO1P40527 1151 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D COS4P43542 379 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data3.12□□□□□ -1.91not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D YGL176CP46945 554 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D AIM22P47051 409 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D APS3P47064 194 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D NAS6P50086 228 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D YPT32P51996 222 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D MRM2P53123 320 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D FHN1P53279 174 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D IDP3P53982 420 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D ERG13P54839 491 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D AAT1Q01802 451 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D LGE1Q02796 332 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2A-DR2Q03483 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D ECM11Q04110 302 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D ATG38Q05789 226 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D RIF2Q06208 395 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D TDA5Q06417 326 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D ENT4Q07872 247 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D NBA1Q08229 501 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D ESA1Q08649 445 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D MMT2Q08970 484 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D MLH3Q12083 715 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D RUP1Q12242 671 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2A-BQ12260 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2A-OR2Q12293 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2A-DR1Q12392 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2A-OR1Q12439 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D NOP58Q12499 511 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D PAR32Q12515 295 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D YOR032W-AQ8TGS1 66 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2A-DR3Q99303 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D NUM1Q00402 2748 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D HFA1P32874 2273 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D CSF1Q12150 2958 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D COX1P00401 534 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D CAR1P00812 333 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D ARG4P04076 463 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D HXK2P04807 486 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D HTA2P04912 132 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D ATP4P05626 244 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D RPL7AP05737 244 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D CYT1P07143 309 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D NPR1P22211 790 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D APN1P22936 367 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D DBR1P24309 405 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D RVS161P25343 265 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D SLM5P25345 492 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D YCR102CP25608 368 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D YCR051WP25631 222 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D BUB2P26448 306 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D NUD1P32336 851 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D AAR2P32357 355 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D SSO1P32867 290 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D ATO2P32907 282 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D DOA1P36037 715 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D RRN3P36070 627 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D VRP1P37370 817 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D COS111P38308 924 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D SHU2P38957 223 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D SEC31P38968 1273 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D SER3P40054 469 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D ICE2P40499 491 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D AZF1P41696 914 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D RPL10P41805 221 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)DtK(UUU)D SEC26P41810 973 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12 ms